44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0436 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  100 
 
 		 499 aa  978    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  60.46 
 
 		 523 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  62.91 
 
 		 589 aa  344  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  56.02 
 
 		 603 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  55.52 
 
 		 629 aa  325  9e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0574  TraB determinant protein  39.36 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.247914  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  35.76 
 
 		 461 aa  276  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  38.8 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  36.3 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  43.35 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  40.08 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  40.89 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  37.08 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  33.93 
 
 		 423 aa  148  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  28.61 
 
 		 404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  27.44 
 
 		 404 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  29.71 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  34.25 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  41.04 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  27.63 
 
 		 399 aa  99.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  32.41 
 
 		 390 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  40.74 
 
 		 243 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  38.85 
 
 		 391 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  26.46 
 
 		 405 aa  94  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  31.67 
 
 		 392 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  36.36 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  29.29 
 
 		 380 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  36.08 
 
 		 400 aa  90.5  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  34.97 
 
 		 387 aa  90.1  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  40.97 
 
 		 403 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  30.66 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  41.61 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  27.16 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  31.65 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  34.97 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  28.47 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  27.67 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31114  predicted protein  28.76 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2810  TraB determinant protein  35.54 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  39.69 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  27.02 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  28.51 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1134  TraB determinant protein  31.85 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  29.66 
 
 		 256 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>