More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4127 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4127  HflK protein  100 
 
 
375 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.848756  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  38.72 
 
 
308 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  38.18 
 
 
405 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  38.38 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  36.09 
 
 
367 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  36.71 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.72 
 
 
413 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  36.26 
 
 
361 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  36.97 
 
 
359 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  36.39 
 
 
388 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  38.55 
 
 
378 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  35.47 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  35.1 
 
 
385 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  33.79 
 
 
344 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4125  HflK protein  38.25 
 
 
515 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.9 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  38.6 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  34.25 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  34.77 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  35.44 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  34.48 
 
 
309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  33.55 
 
 
433 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  34.33 
 
 
406 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  32.64 
 
 
331 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  32.79 
 
 
362 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  35.13 
 
 
368 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  36.24 
 
 
403 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  34.93 
 
 
379 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  36.11 
 
 
350 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  33.78 
 
 
395 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  32.32 
 
 
447 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  31.63 
 
 
306 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  33.33 
 
 
382 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  32.27 
 
 
383 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  32.78 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  34.48 
 
 
383 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  35.13 
 
 
351 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  32.4 
 
 
457 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  36.18 
 
 
333 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.2 
 
 
405 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  37.11 
 
 
393 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  33.56 
 
 
383 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.2 
 
 
393 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  31.97 
 
 
384 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  37.11 
 
 
379 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  37.11 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  34.71 
 
 
400 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  36.77 
 
 
393 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  36.68 
 
 
389 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  34.13 
 
 
379 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  31.66 
 
 
382 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  33.57 
 
 
383 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  33.67 
 
 
390 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  31.48 
 
 
329 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31 
 
 
498 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  34.36 
 
 
399 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  29.67 
 
 
322 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  34.33 
 
 
395 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  32.28 
 
 
389 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  33.33 
 
 
376 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  33.44 
 
 
389 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.05 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  33.89 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  35.49 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  34.95 
 
 
350 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  31.34 
 
 
436 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  34.95 
 
 
350 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  30.56 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  31.88 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  31.29 
 
 
382 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  31.15 
 
 
503 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  32.89 
 
 
357 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  31.43 
 
 
452 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  35.15 
 
 
395 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3016  HflK protein  35.43 
 
 
377 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.579125  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  32.39 
 
 
447 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  30.97 
 
 
420 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  31.49 
 
 
465 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3333  HflK protein  30.31 
 
 
374 aa  143  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  31.74 
 
 
355 aa  142  7e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  33.22 
 
 
382 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  35.29 
 
 
378 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  32.21 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  31.88 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  32.21 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  36.03 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  31.66 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  32.66 
 
 
389 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  33.33 
 
 
375 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  33.22 
 
 
464 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  31.77 
 
 
477 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  31.96 
 
 
475 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  31.8 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  31.54 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  33.66 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  33.66 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0357  FtsH protease regulator HflK  32.74 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398708  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0545  HflK protein  31.63 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000873771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  32.76 
 
 
393 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  32.76 
 
 
393 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>