More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1703 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
243 aa  486  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00213351  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2135  short chain dehydrogenase / reductase  56.07 
 
 
221 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.658978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
221 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.248374  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 
221 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
236 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2453  putative oxidoreductase (NAD/NADP dependent)  53 
 
 
221 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 
215 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0331104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 
248 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.99 
 
 
255 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.78 
 
 
246 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  46.58 
 
 
246 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
246 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
250 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 
239 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
250 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
249 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3931  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
247 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.198778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
247 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 
257 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
247 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
261 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
247 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059287  normal  0.09435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
254 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.91 
 
 
247 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.14 
 
 
247 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.851673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 
244 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
248 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.37567  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
238 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
237 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
249 aa  141  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0803391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.6 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.23 
 
 
249 aa  133  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.7 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 
248 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0646  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  28.37 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  30.6 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  28.97 
 
 
245 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0366  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.39 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.357183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  28.18 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  28.83 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  27.96 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  31.43 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  27.93 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  31.8 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  26.99 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  28.37 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  28.37 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
255 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  32.24 
 
 
1270 aa  78.6  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  28.37 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  27.91 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.5 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2342  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.8 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  26.24 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  30.19 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  26.55 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23650  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0188614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
272 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  26.55 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  26.03 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  30.1 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>