More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2342 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2342  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  55.92 
 
 
247 aa  281  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  48.74 
 
 
245 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 
261 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 
245 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  43.67 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
245 aa  218  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
250 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  45.64 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  47.33 
 
 
263 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
263 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 
291 aa  215  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
247 aa  214  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  42.74 
 
 
254 aa  214  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  44.81 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  45.8 
 
 
245 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  45.8 
 
 
245 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  45.8 
 
 
245 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 
245 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
246 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  45.11 
 
 
258 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.142486  hitchhiker  0.0000000171216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 
247 aa  197  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15740  short chain dehydrogenase  48.75 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
245 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1843  short chain dehydrogenase  45.9 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0503797  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
245 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
252 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00434929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4083  short chain dehydrogenase  46.86 
 
 
246 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2121  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 
245 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000029074  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  46.22 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1956  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 
246 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 
245 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23200  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246989  hitchhiker  0.000850788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  44.54 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1354  short chain dehydrogenase  46.47 
 
 
246 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1763  short chain dehydrogenase  46.44 
 
 
246 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755311  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2357  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
252 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596185  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1470  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
252 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1860  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
252 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000976812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1380  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
252 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1903  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
252 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000124069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3951  short chain dehydrogenase  46.44 
 
 
246 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010229  hitchhiker  0.00832612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1370  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 
246 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  41.28 
 
 
269 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
269 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01247  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 
252 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
252 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0592861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01257  hypothetical protein  42.32 
 
 
252 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1495  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 
252 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 
243 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1927  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
253 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2199  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 
253 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2037  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
253 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2307  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
253 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1926  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
253 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.641553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2167  short chain dehydrogenase  41.49 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3652  short chain dehydrogenase  44.81 
 
 
246 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.816797  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 
253 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 
276 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1740  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.98 
 
 
246 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2012  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2313  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1271  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.53 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
239 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0763173  hitchhiker  0.00365487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
237 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0980  putative exported oxidoreductase  33.48 
 
 
239 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
250 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
244 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
249 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
258 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0796493  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
246 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
239 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.851673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
247 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
243 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059287  normal  0.09435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.37567  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3931  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.198778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
246 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>