More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1375 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 258 aa  497  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0796493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01316  short chain dehydrogenase  65.84 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  40.57 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2342  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  34.19 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  35.74 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00434929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1354  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 		 246 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1843  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0503797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1763  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3951  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010229  hitchhiker  0.00832612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 245 aa  148  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15740  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  40.85 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1370  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4083  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1956  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.142486  hitchhiker  0.0000000171216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  35.9 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2121  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000029074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23200  short chain dehydrogenase  41.71 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246989  hitchhiker  0.000850788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1740  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.1 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3652  short chain dehydrogenase  40.25 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.816797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.65 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0763173  hitchhiker  0.00365487 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1188  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1860  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000976812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1903  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000124069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2357  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596185  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1380  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2167  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1470  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1495  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01247  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0592861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01257  hypothetical protein  34.8 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2199  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1271  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.6 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2135  short chain dehydrogenase / reductase  33.03 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.658978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2037  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2307  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1926  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.641553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1927  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2012  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2313  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.59 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  28.46 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0980  putative exported oxidoreductase  28.87 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.67 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>