More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1762 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.27 
 
 
244 aa  275  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.55 
 
 
236 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 
246 aa  188  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 
255 aa  187  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
239 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
249 aa  185  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.09 
 
 
249 aa  182  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 
250 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
248 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
250 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 
247 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
247 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 
246 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  42.99 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
247 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
246 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3931  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
247 aa  168  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.198778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
247 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
247 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.851673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
247 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059287  normal  0.09435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 
237 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0803391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
254 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
243 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
253 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
245 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2135  short chain dehydrogenase / reductase  41.74 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.658978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  38.79 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 
295 aa  146  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
247 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 
245 aa  144  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
248 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.37567  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
257 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 
248 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  38.79 
 
 
248 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 
258 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 
248 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
245 aa  138  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
261 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
236 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 
245 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 
245 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 
245 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
245 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
245 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0366  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.63 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.357183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4083  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
245 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0646  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15740  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2121  short chain dehydrogenase  39.73 
 
 
245 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000029074  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1763  short chain dehydrogenase  42.73 
 
 
246 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755311  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3951  short chain dehydrogenase  42.27 
 
 
246 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010229  hitchhiker  0.00832612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  34.08 
 
 
247 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.84 
 
 
269 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
269 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.44 
 
 
263 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
263 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1843  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 
259 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0503797  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
245 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 
245 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
245 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
245 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1354  short chain dehydrogenase  41.82 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801717  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2342  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
248 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1370  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23200  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246989  hitchhiker  0.000850788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2167  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 
253 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00213351  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1956  short chain dehydrogenase  40.28 
 
 
246 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3652  short chain dehydrogenase  41.89 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.816797  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1740  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.99 
 
 
246 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
235 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2012  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1927  short chain dehydrogenase  33.64 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1293  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.19 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
253 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0592861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01257  hypothetical protein  33.05 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>