More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1293 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1293  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0646  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
241 aa  223  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0366  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.96 
 
 
242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.357183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
249 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.02 
 
 
246 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.02 
 
 
255 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
261 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
254 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0803391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
247 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.851673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
247 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3931  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.198778 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.33 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059287  normal  0.09435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0446  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.05 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
246 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
247 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
250 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
247 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
248 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.37567  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  35.71 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
291 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
295 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 
246 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
236 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
239 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  30.47 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 
245 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2121  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000029074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  32.88 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 
245 aa  92  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
239 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  28.15 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
274 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
244 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.87 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  30.29 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.39 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  31.77 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  31.08 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 
245 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
260 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
245 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2199  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>