More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0366 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0366  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.357183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0646  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.89 
 
 
241 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1293  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.96 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
249 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
246 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.59 
 
 
246 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.59 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
239 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3931  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
247 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.198778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
249 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0803391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
247 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.851673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
247 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059287  normal  0.09435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
237 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
248 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.89 
 
 
249 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
247 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
250 aa  148  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
246 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
236 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0446  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.78 
 
 
224 aa  143  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
244 aa  141  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
247 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  33.19 
 
 
246 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
248 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.37567  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
250 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
243 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
247 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
245 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
243 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
235 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  30.33 
 
 
291 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
295 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
247 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
269 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.17 
 
 
269 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.08 
 
 
253 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  33.17 
 
 
247 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 
246 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 
245 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
261 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  28.75 
 
 
253 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 
248 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  30.58 
 
 
254 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
258 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
253 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 
245 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
239 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
248 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
245 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  30.18 
 
 
248 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
249 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
254 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
254 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  28.76 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 
244 aa  99  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.7 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.75 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00434929  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
292 aa  95.5  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  30.54 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1188  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  29.72 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>