More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1271 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1271  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
255 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  38.63 
 
 
248 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  38.59 
 
 
254 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  39.75 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  42.06 
 
 
247 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 
245 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
245 aa  168  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  39.05 
 
 
258 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2342  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
248 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 
248 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 
245 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
245 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  38.56 
 
 
248 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 
245 aa  161  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.5 
 
 
263 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
263 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
246 aa  158  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
245 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
291 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
295 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 
247 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  40 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
254 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2121  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 
245 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000029074  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
245 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
245 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
245 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00434929  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.74 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1843  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
259 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0503797  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
243 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4083  short chain dehydrogenase  38.3 
 
 
246 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15740  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 
252 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
238 aa  141  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1354  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1763  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755311  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3951  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010229  hitchhiker  0.00832612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1740  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.15 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1370  short chain dehydrogenase  38.3 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
253 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
253 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
253 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
253 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2037  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1926  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.641553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2307  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1470  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1860  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000976812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 
276 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01247  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0592861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1495  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01257  hypothetical protein  37.23 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
239 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.142486  hitchhiker  0.0000000171216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3652  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 
246 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.816797  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2357  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596185  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1380  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1903  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000124069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2199  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 
253 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1956  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
246 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2167  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
253 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.851673 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.77 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.77 
 
 
255 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
247 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23200  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246989  hitchhiker  0.000850788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1927  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.06 
 
 
249 aa  125  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
249 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0803391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
250 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
247 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059287  normal  0.09435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
246 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
246 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
237 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
250 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3931  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
247 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.198778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 
248 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.37567  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
246 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  36.65 
 
 
246 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
254 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01316  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
230 aa  118  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>