More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01316 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01316  short chain dehydrogenase  100 
 
 
230 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.15 
 
 
258 aa  238  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0796493  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  43.98 
 
 
263 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
263 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0577  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 
247 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000371974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 
245 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
252 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00434929  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
245 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2572  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 
245 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 
245 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
246 aa  141  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02865  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
248 aa  141  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2715  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2792  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179947  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  35.75 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2694  short chain dehydrogenase  38.86 
 
 
245 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1672  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 
245 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245982  hitchhiker  0.00123498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  38.14 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
261 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
247 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000966218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 
258 aa  134  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01893  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000187394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2121  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000029074  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2396  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 
245 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000375215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2935  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1534  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
245 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00546516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1528  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
245 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272639  hitchhiker  0.000286481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0324346  normal  0.993482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4083  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1468  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0118421  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1191  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2342  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1763  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
246 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755311  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3951  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
246 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010229  hitchhiker  0.00832612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1370  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
246 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1354  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801717  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.57 
 
 
269 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
243 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
269 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1843  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 
259 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0503797  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15740  short chain dehydrogenase  40.46 
 
 
252 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 
291 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0123  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.974335  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1699  oxidoreductase  42.27 
 
 
247 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.782985  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1956  short chain dehydrogenase  36.42 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1740  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.18 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1188  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
232 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23200  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 
246 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246989  hitchhiker  0.000850788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
247 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.142486  hitchhiker  0.0000000171216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1271  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.94 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3652  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.816797  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2135  short chain dehydrogenase / reductase  36.63 
 
 
221 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.658978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1470  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
252 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1860  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
252 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000976812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
239 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01247  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0592861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01257  hypothetical protein  36.27 
 
 
252 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1495  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
252 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1903  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000124069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2357  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.596185  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1380  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  36 
 
 
276 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2199  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1907  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000106494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1611  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000230658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1844  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000457135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1429  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
269 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0763173  hitchhiker  0.00365487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1849  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714478  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
250 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2037  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2167  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
253 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2307  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 
253 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1926  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 
253 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.641553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
243 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.396766  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1927  short chain dehydrogenase  32.18 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
254 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
250 aa  85.5  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
238 aa  85.1  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00213351  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2012  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0331104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.248374  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3786  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>