More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4632 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
387 aa  775    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.78 
 
 
408 aa  282  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.75 
 
 
411 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.75 
 
 
411 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.75 
 
 
400 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  34.75 
 
 
411 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  34.75 
 
 
411 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.22 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.69 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.78 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.95 
 
 
411 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.47 
 
 
403 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.16 
 
 
400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.86 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  41.43 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  33.42 
 
 
400 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  33.16 
 
 
400 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.87 
 
 
389 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  40.41 
 
 
406 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  39.9 
 
 
406 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  39.13 
 
 
401 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  31.44 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.86 
 
 
398 aa  172  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.2 
 
 
390 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.65 
 
 
373 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.49 
 
 
369 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.05 
 
 
373 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.83 
 
 
373 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 
910 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 
892 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 
892 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
892 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 
892 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
882 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 
889 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.74 
 
 
236 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
904 aa  123  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 
892 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
914 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.19 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
892 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 
916 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
896 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
926 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
913 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
899 aa  116  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
883 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 
923 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.16 
 
 
233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
913 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 
856 aa  111  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 
892 aa  111  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
870 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.32 
 
 
383 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
923 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.8 
 
 
232 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.5 
 
 
403 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.45 
 
 
265 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
872 aa  106  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
924 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
913 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.94 
 
 
243 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
865 aa  103  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0205  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
884 aa  103  4e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  30.07 
 
 
430 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0125  alanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
875 aa  102  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 
876 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
881 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
863 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.64 
 
 
432 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 
885 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
900 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.06 
 
 
240 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
865 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
892 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.73 
 
 
249 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 
876 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.83 
 
 
236 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.09 
 
 
234 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 
884 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 
925 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 
890 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 
907 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 
926 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.69 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
926 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
878 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.52 
 
 
235 aa  97.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
874 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 
876 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 
875 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 
876 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 
876 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 
876 aa  96.3  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 
876 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.38 
 
 
239 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
878 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 
876 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
868 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  28.34 
 
 
876 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>