More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53118 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  100 
 
 		 430 aa  887    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04320  cytoplasm protein, putative  34.38 
 
 		 523 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  30.93 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.24 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.96 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.71 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.32 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.45 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.66 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  30.56 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  30.07 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  30.42 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.62 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.62 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.62 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  29.62 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  29.62 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.07 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.31 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.07 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.53 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 		 910 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.3 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.23 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  34.82 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.31 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.04 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  34.38 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.06 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 882 aa  94  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 926 aa  92.8  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 926 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.44 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 882 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  27.89 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 892 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 914 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 		 892 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  27.37 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 899 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 892 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.16 
 
 		 236 aa  86.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 872 aa  85.5  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.57 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 892 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.08 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 892 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 926 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 		 916 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 925 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.59 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.59 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 896 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 881 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 915 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.1 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.27 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1432  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.32 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.77 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 892 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.27 
 
 		 243 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 913 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.67 
 
 		 234 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.38 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 883 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 892 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 889 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  22.7 
 
 		 906 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 924 aa  76.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 		 892 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 870 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  33.16 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 865 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 872 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 896 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 913 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.74 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  24.46 
 
 		 878 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.97 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  23.45 
 
 		 894 aa  73.6  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 904 aa  73.2  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  23.18 
 
 		 884 aa  73.2  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 		 913 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  24.23 
 
 		 872 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 885 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 		 879 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  22.12 
 
 		 881 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.03 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.18 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1118  alanyl-tRNA synthetase  22.86 
 
 		 857 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 880 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  21.59 
 
 		 879 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  26.27 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 		 890 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.02 
 
 		 239 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 		 907 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>