More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0209 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
390 aa  795    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  68.45 
 
 
398 aa  541  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  29.3 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.38 
 
 
400 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.03 
 
 
411 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.03 
 
 
411 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.61 
 
 
400 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  28.61 
 
 
411 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.12 
 
 
400 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.18 
 
 
400 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.03 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.72 
 
 
414 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.07 
 
 
400 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.2 
 
 
387 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  28.3 
 
 
400 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  28.03 
 
 
400 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.62 
 
 
373 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.32 
 
 
403 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.33 
 
 
373 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.21 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.91 
 
 
408 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.92 
 
 
408 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.83 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  36.92 
 
 
406 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.32 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  36.2 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.17 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.77 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
892 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
892 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 
892 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
926 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.24 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
925 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
926 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
882 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
926 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
915 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
892 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.91 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
914 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  38.07 
 
 
236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
907 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  25.4 
 
 
404 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
913 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
892 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
913 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
923 aa  110  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 
910 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
924 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
923 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
916 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
904 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
896 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
913 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 
889 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
892 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
900 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.21 
 
 
232 aa  99.8  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
886 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
886 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  32.91 
 
 
236 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.86 
 
 
265 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 
892 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  30.07 
 
 
906 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
899 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
874 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
886 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
872 aa  97.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 
889 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 
879 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.2 
 
 
235 aa  94.4  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 
889 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 
868 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
892 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.61 
 
 
237 aa  93.6  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 
865 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 
879 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 
889 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.74 
 
 
238 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  32.64 
 
 
245 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 
881 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.95 
 
 
243 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.95 
 
 
243 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.93 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 
899 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 
880 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 
862 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.91 
 
 
234 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
892 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.63 
 
 
252 aa  89.7  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 
874 aa  89.4  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 
880 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 
877 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 
903 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  29.88 
 
 
243 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
892 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
890 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  28.57 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
871 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>