More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0714 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  100 
 
 
400 aa  807    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  99.25 
 
 
400 aa  805    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.42 
 
 
411 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.9 
 
 
411 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.9 
 
 
411 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  35.16 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.47 
 
 
400 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  34.47 
 
 
411 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  34.47 
 
 
411 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.9 
 
 
400 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.47 
 
 
400 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  34.64 
 
 
400 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.16 
 
 
387 aa  225  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.65 
 
 
414 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.45 
 
 
389 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.76 
 
 
408 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.69 
 
 
403 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.5 
 
 
398 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.85 
 
 
408 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.03 
 
 
390 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.72 
 
 
401 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  27.25 
 
 
404 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  30.89 
 
 
406 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  30.81 
 
 
406 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.81 
 
 
369 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.19 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.91 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.72 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.92 
 
 
363 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.71 
 
 
383 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 
913 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.47 
 
 
236 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 
892 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  24.87 
 
 
881 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
892 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
925 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 
900 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
874 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 
913 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.85 
 
 
238 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  25.55 
 
 
924 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.62 
 
 
238 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 
870 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  23.88 
 
 
885 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 
883 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  25.94 
 
 
926 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 
916 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
872 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
904 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.44 
 
 
240 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
910 aa  106  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  24.63 
 
 
926 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
896 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 
892 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
880 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
872 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
914 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  26.77 
 
 
430 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.36 
 
 
236 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.77 
 
 
238 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.18 
 
 
243 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.62 
 
 
236 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.62 
 
 
236 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  33.62 
 
 
236 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1432  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28 
 
 
387 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
892 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
892 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  24.28 
 
 
926 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.09 
 
 
236 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.09 
 
 
236 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.09 
 
 
236 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 
923 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 
889 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.46 
 
 
233 aa  96.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 
865 aa  97.1  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
884 aa  96.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.33 
 
 
238 aa  97.1  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 
892 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.88 
 
 
232 aa  96.3  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.09 
 
 
236 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
892 aa  95.9  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
886 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  23.82 
 
 
923 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  34.09 
 
 
236 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 
884 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 
886 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  24.21 
 
 
897 aa  93.6  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.48 
 
 
234 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.8 
 
 
242 aa  93.6  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 
886 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.64 
 
 
236 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  24.94 
 
 
879 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
874 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 
874 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 
878 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 
875 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
874 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 
869 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 
880 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 
876 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>