More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2025 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  100 
 
 
240 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  48.26 
 
 
237 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  46.32 
 
 
245 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  46.58 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.89 
 
 
239 aa  188  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.32 
 
 
239 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.38 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
246 aa  178  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  45.57 
 
 
239 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  45.15 
 
 
239 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  42.92 
 
 
239 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
239 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.15 
 
 
243 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  40.33 
 
 
243 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  40.33 
 
 
243 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
255 aa  165  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.15 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  39.66 
 
 
245 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
250 aa  162  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  39.51 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.62 
 
 
250 aa  161  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  40.4 
 
 
252 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.51 
 
 
243 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  39.09 
 
 
243 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.51 
 
 
243 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.49 
 
 
245 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  39.33 
 
 
247 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  38.91 
 
 
247 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  39.34 
 
 
243 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  39.34 
 
 
243 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  39.34 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  39.34 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  39.34 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
243 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.97 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.56 
 
 
249 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  38.52 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  37.12 
 
 
243 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  39 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.02 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.32 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.15 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  32.35 
 
 
236 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  32.35 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  32.35 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.12 
 
 
246 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.34 
 
 
265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.77 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.25 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  32.77 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.77 
 
 
236 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.82 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
900 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.46 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  32.77 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.74 
 
 
408 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.51 
 
 
236 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.08 
 
 
236 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.33 
 
 
255 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.06 
 
 
237 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 
892 aa  105  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
237 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.65 
 
 
236 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.39 
 
 
238 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.34 
 
 
238 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.06 
 
 
387 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.86 
 
 
238 aa  99  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
914 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  32.33 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1785  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  33.91 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.170383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0336  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  33.91 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1871  putative alanyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0961  alanyl-tRNA synthetase-related protein  34.07 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
896 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1375  alanyl-tRNA synthetase-related protein  34.07 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0902986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0417  alanyl-tRNA synthetase-related protein  34.07 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0225  alanyl-tRNA synthetase-related protein  34.07 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0319301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 
915 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
882 aa  94.4  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
913 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.25 
 
 
403 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
913 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.87 
 
 
239 aa  91.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 
910 aa  91.7  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
904 aa  91.3  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
892 aa  90.9  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.4 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
892 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.25 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
892 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
892 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0971  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.52 
 
 
293 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
892 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
926 aa  88.6  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
892 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.33 
 
 
403 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.09 
 
 
411 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
913 aa  86.3  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>