More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3853 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
250 aa  497  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  99.2 
 
 
250 aa  494  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  78.31 
 
 
255 aa  377  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  70.52 
 
 
252 aa  354  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  71.15 
 
 
249 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  53.23 
 
 
243 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  53.23 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  52.8 
 
 
243 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  52.19 
 
 
243 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  50.81 
 
 
243 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  53.2 
 
 
243 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  53.2 
 
 
243 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  53.2 
 
 
243 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  52.99 
 
 
243 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  50.81 
 
 
243 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  50.4 
 
 
243 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
243 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  52.99 
 
 
243 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 
239 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.34 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  49.8 
 
 
245 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.57 
 
 
239 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  44.72 
 
 
245 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  50.2 
 
 
239 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.9 
 
 
245 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  49.8 
 
 
239 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  46.8 
 
 
237 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  46.99 
 
 
238 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  49.8 
 
 
239 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
245 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.22 
 
 
236 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  42 
 
 
247 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  41.6 
 
 
247 aa  195  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
246 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.53 
 
 
239 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.77 
 
 
247 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  42.62 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.07 
 
 
243 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.66 
 
 
232 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.06 
 
 
235 aa  131  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  32.14 
 
 
236 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.8 
 
 
236 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.08 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.08 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  30.68 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.58 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.08 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.08 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  30.68 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.75 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.28 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.27 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.28 
 
 
236 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.68 
 
 
242 aa  112  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.56 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.98 
 
 
238 aa  105  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.69 
 
 
233 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.55 
 
 
238 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.33 
 
 
238 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.94 
 
 
238 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 
900 aa  102  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.98 
 
 
252 aa  102  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.39 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
892 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.22 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
904 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
899 aa  95.9  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
896 aa  95.1  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  32.57 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 
892 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
907 aa  89.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 
237 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
892 aa  88.6  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.66 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.17 
 
 
239 aa  85.1  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.95 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  30.33 
 
 
916 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 
913 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
878 aa  84  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.74 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  30.94 
 
 
894 aa  82.8  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.18 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.97 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
854 aa  82.4  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
881 aa  82  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
863 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
874 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 
874 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
856 aa  80.5  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
881 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.52 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
894 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.16 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 
900 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
874 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 
882 aa  79  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
874 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
865 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 
874 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>