More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0951 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 876 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 876 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 874 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 875 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 874 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 892 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 867 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 896 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 874 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 874 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 904 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 875 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 874 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 874 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 874 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 863 aa  635    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 874 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 860 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 860 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 899 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 876 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 865 aa  668    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 875 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 874 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 876 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  44.04 
 
 		 873 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 874 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 882 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 897 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 897 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 874 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 876 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 891 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 864 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 874 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 875 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 865 aa  667    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 876 aa  671    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 897 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 881 aa  672    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 874 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0087  alanyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 884 aa  647    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000138455  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 863 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 891 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 882 aa  661    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 874 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 876 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 875 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 892 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 874 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 878 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 874 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 874 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 865 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 868 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 897 aa  635    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 876 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 884 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 876 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 874 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 897 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 865 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 863 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 882 aa  672    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 897 aa  656    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 869 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 875 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 892 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 874 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 874 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 874 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 897 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 878 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 884 aa  648    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 874 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 878 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 860 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 885 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 875 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 874 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 867 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 876 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 879 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 874 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 874 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 903 aa  646    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>