More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2345 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  100 
 
 
237 aa  477  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  83.33 
 
 
238 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  75.11 
 
 
236 aa  357  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  72.88 
 
 
239 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  69.07 
 
 
245 aa  321  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  72.46 
 
 
239 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
255 aa  222  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  49.8 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.15 
 
 
249 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.98 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  42.44 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.28 
 
 
247 aa  208  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  48.41 
 
 
252 aa  207  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
250 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  48.33 
 
 
239 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  47.35 
 
 
243 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.94 
 
 
243 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
239 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  47.92 
 
 
239 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.4 
 
 
250 aa  204  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
243 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.12 
 
 
243 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.74 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  44.94 
 
 
243 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  44.53 
 
 
243 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.45 
 
 
245 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.31 
 
 
243 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  45.83 
 
 
239 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  48.26 
 
 
240 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  44.9 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  44.44 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  44.9 
 
 
243 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  44.9 
 
 
243 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  44.9 
 
 
243 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
243 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.48 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  37.25 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.33 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  34.76 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  34.33 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.33 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.03 
 
 
236 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.76 
 
 
236 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  34.19 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.91 
 
 
236 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.33 
 
 
236 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.76 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  33.91 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.04 
 
 
233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.44 
 
 
240 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.76 
 
 
243 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.77 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.91 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.53 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.17 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.71 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
237 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.84 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.8 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.54 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.38 
 
 
238 aa  109  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.12 
 
 
238 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.78 
 
 
252 aa  102  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1871  putative alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
239 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0336  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  33.33 
 
 
239 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1785  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  33.33 
 
 
239 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.170383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
900 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0961  alanyl-tRNA synthetase-related protein  33.19 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1375  alanyl-tRNA synthetase-related protein  33.19 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0902986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0225  alanyl-tRNA synthetase-related protein  33.19 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0319301  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0417  alanyl-tRNA synthetase-related protein  33.19 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
907 aa  95.9  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
892 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.63 
 
 
408 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.61 
 
 
390 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.87 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  29.26 
 
 
404 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
896 aa  88.6  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
914 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  31.34 
 
 
906 aa  86.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 
892 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.05 
 
 
398 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
892 aa  85.9  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 
904 aa  85.1  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0660  hypothetical protein  31.11 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
878 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
880 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  32.74 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
882 aa  82.8  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.56 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  28.32 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 
880 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0131  hypothetical protein  28.38 
 
 
224 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0641212  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
899 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.05 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.73 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>