More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0961 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0961  alanyl-tRNA synthetase-related protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0417  alanyl-tRNA synthetase-related protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0225  alanyl-tRNA synthetase-related protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0319301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1375  alanyl-tRNA synthetase-related protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0902986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0336  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  99.58 
 
 
239 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1785  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  99.58 
 
 
239 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.170383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1871  putative alanyl-tRNA synthetase  99.58 
 
 
239 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
237 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  53.81 
 
 
237 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5692  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  50.85 
 
 
243 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
239 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  40 
 
 
246 aa  121  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.9 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  31 
 
 
236 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.51 
 
 
239 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31 
 
 
236 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.21 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.57 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.57 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  31.44 
 
 
236 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.32 
 
 
239 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.77 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.19 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.88 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 
246 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.13 
 
 
233 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.82 
 
 
236 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.32 
 
 
236 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.19 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.94 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.88 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.71 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.77 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.07 
 
 
240 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.76 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.06 
 
 
239 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.58 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.92 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  34.53 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.69 
 
 
238 aa  89  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.57 
 
 
236 aa  88.6  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.2 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  30.63 
 
 
404 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
907 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.95 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.22 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.14 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
889 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.15 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.94 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
889 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.82 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  30.6 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.77 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  25.36 
 
 
865 aa  79  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  30.17 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
881 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 
913 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.05 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.77 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
892 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.69 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
896 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 
913 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2551  alanyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 
870 aa  75.1  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.08 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.92 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 
875 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
885 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  32.56 
 
 
890 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 
892 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.53 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  31.28 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.8 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.84 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 
892 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
876 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
876 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
876 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
876 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  28.14 
 
 
876 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0223  alanyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 
894 aa  72  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0181746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
881 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
892 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
876 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
876 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  31.68 
 
 
873 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.3 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
892 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>