More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5692 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5692  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1785  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  51.27 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.170383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0336  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  51.27 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1871  putative alanyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
239 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0961  alanyl-tRNA synthetase-related protein  50.85 
 
 
239 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1375  alanyl-tRNA synthetase-related protein  50.85 
 
 
239 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0902986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0225  alanyl-tRNA synthetase-related protein  50.85 
 
 
239 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0319301  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0417  alanyl-tRNA synthetase-related protein  50.85 
 
 
239 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  44.12 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
237 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.62 
 
 
244 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.8 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.8 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  30.8 
 
 
236 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.97 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.79 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.8 
 
 
236 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.8 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  31.25 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.8 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.88 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.8 
 
 
236 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.08 
 
 
236 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
881 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  32.13 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.7 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.91 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
872 aa  89  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.64 
 
 
233 aa  88.6  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
880 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.77 
 
 
403 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
881 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
907 aa  86.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.62 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
876 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
880 aa  85.5  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.38 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
865 aa  84  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.49 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 
874 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.67 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
899 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
889 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
882 aa  82.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
879 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 
923 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  24.65 
 
 
879 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
899 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.57 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.67 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  22.86 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 
880 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 
904 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
886 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 
889 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 
879 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.69 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1383  alanyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 
942 aa  79.3  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0477098  hitchhiker  0.00263773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.62 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
878 aa  78.6  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  25.69 
 
 
892 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  29.22 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
879 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  28.17 
 
 
890 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 
874 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.54 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
876 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 
913 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
900 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  28.77 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  23.7 
 
 
880 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
874 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.47 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
924 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
875 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
892 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 
889 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  30.45 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
885 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
885 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.68 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  30.45 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.89 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  30.45 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  24.77 
 
 
892 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  30.45 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
913 aa  73.2  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 
886 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 
926 aa  72.8  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  30.45 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 
874 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
910 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.91 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  25.12 
 
 
900 aa  72.4  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.35 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.44 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
874 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>