More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4033 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  100 
 
 
403 aa  822    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.1 
 
 
411 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.59 
 
 
400 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.67 
 
 
400 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.47 
 
 
387 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.42 
 
 
411 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33.85 
 
 
411 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33.42 
 
 
411 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.42 
 
 
411 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.08 
 
 
414 aa  223  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.08 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.08 
 
 
400 aa  222  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.08 
 
 
400 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.38 
 
 
408 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.8 
 
 
408 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.36 
 
 
398 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  30.39 
 
 
404 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  30.69 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  30.45 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.17 
 
 
389 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  35.64 
 
 
406 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  40.89 
 
 
401 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  35.32 
 
 
406 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.61 
 
 
369 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.32 
 
 
390 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35 
 
 
373 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 
925 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.19 
 
 
373 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
924 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.74 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
926 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
916 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
913 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.41 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
926 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 
914 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
892 aa  124  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
915 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
926 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
900 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
904 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 
923 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.89 
 
 
243 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 
880 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 
882 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
907 aa  117  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 
856 aa  116  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
881 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  38.91 
 
 
234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
913 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.39 
 
 
232 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 
892 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
892 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
896 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 
877 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 
910 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 
883 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 
865 aa  110  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
868 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
892 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
878 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 
913 aa  107  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 
865 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.39 
 
 
363 aa  106  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
892 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 
865 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 
874 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
885 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 
879 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
889 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 
889 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
876 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.88 
 
 
265 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
875 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
875 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
892 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.51 
 
 
236 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
880 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
875 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 
877 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
892 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
860 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 
875 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 
892 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 
872 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
878 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 
875 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  28.07 
 
 
430 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
904 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.77 
 
 
240 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
880 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 
864 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
875 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  26.44 
 
 
923 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
872 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 
878 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 
876 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 
876 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
874 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 
875 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>