More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3568 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
408 aa  825    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.58 
 
 
387 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.33 
 
 
400 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.16 
 
 
400 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.68 
 
 
414 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.68 
 
 
411 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  43 
 
 
408 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.9 
 
 
411 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  32.9 
 
 
411 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.9 
 
 
411 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.9 
 
 
400 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  32.9 
 
 
411 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.64 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.64 
 
 
400 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  42.04 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  41.04 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.76 
 
 
403 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.09 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.28 
 
 
401 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  33.16 
 
 
404 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  28.03 
 
 
400 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  27.78 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.65 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
923 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
925 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 
913 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.91 
 
 
390 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  33 
 
 
926 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 
924 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
900 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 
882 aa  136  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.23 
 
 
373 aa  132  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.19 
 
 
373 aa  130  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.21 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 
914 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
926 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 
865 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 
865 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 
896 aa  127  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
904 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
874 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 
926 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 
923 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.48 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
874 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  30.96 
 
 
430 aa  121  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 
916 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
874 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
892 aa  120  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  33.62 
 
 
249 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.27 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
892 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 
913 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
892 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
892 aa  116  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 
899 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
897 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
897 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
892 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
897 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
874 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 
875 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.34 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 
892 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
874 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.41 
 
 
265 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
872 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
874 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.57 
 
 
236 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.84 
 
 
232 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
907 aa  113  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  25.58 
 
 
856 aa  113  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 
874 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.13 
 
 
233 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
890 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
884 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.88 
 
 
234 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
890 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.74 
 
 
240 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
876 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
876 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 
892 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
893 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 
874 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  25.93 
 
 
876 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
874 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
876 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
884 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.72 
 
 
446 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 
865 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 
876 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
874 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 
875 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 
888 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 
876 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
874 aa  106  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
886 aa  106  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 
892 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>