More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0776 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 		 373 aa  749    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  46.83 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.6 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  44.25 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.02 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  31.81 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.25 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.65 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.25 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.54 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.54 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.54 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  31.54 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.29 
 
 		 411 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  30.71 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.39 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.74 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.47 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.2 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  37.69 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.22 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.23 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.17 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 876 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 876 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.04 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 872 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 876 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  30.77 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 876 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 		 876 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 883 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  30.77 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 876 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 876 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.28 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 876 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 876 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 876 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 876 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 876 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  26.32 
 
 		 876 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 875 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 876 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  36.62 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 876 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  36.15 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 892 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 876 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 865 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 875 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 892 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 892 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 869 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 863 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 878 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 880 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 875 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 892 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 860 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 875 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 860 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 877 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 875 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  25.47 
 
 		 872 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 877 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 884 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 876 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 874 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 		 899 aa  103  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 859 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 916 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 872 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 923 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 892 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  31.3 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 874 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 888 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  24.59 
 
 		 874 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 880 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 907 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 867 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 870 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 884 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1118  alanyl-tRNA synthetase  26.03 
 
 		 857 aa  99.8  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 		 885 aa  99.4  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 882 aa  99.8  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 874 aa  99.4  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 886 aa  99.4  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 880 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 865 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 860 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 878 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 899 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 892 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 		 872 aa  97.1  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 		 874 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 		 860 aa  97.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 889 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 874 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>