More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0917 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  100 
 
 		 363 aa  726    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.83 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.93 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.27 
 
 		 369 aa  271  9e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  43.21 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.01 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.39 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.09 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.36 
 
 		 411 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.12 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.73 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.97 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.73 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.71 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.64 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.64 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.29 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  31.64 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  31.64 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.42 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  31.8 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  31.8 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 879 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.78 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 879 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  28.3 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 872 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 876 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 881 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.58 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 899 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 889 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  31.4 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  30.99 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 883 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  29.07 
 
 		 872 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 880 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  25.82 
 
 		 926 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 877 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 874 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  28.01 
 
 		 874 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 		 877 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.39 
 
 		 401 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 880 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  22.7 
 
 		 408 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 877 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 880 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  26.37 
 
 		 430 aa  95.9  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.3 
 
 		 399 aa  95.9  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 875 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 		 926 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 876 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 856 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  24.66 
 
 		 874 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 872 aa  94  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 874 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 953 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.51 
 
 		 864 aa  93.2  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 879 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 882 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  23.65 
 
 		 897 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 879 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 876 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  28.78 
 
 		 907 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  26.23 
 
 		 926 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 879 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 		 874 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 897 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  23 
 
 		 897 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.5 
 
 		 265 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 872 aa  90.1  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 860 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 874 aa  89.7  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 875 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 		 925 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 		 923 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  25.26 
 
 		 860 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 875 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 		 859 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 880 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 865 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2173  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 899 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 881 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0028  alanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 868 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 886 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 860 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  26.24 
 
 		 906 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 878 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 874 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  22.9 
 
 		 875 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  25.8 
 
 		 876 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 884 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 875 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000779189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 		 869 aa  86.7  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 892 aa  86.3  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.49 
 
 		 234 aa  86.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  22.64 
 
 		 874 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 878 aa  85.9  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 874 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  25.41 
 
 		 885 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>