More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2333 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  100 
 
 		 404 aa  832    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.42 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.5 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.5 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33.74 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33.25 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.73 
 
 		 408 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.25 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.02 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.53 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.47 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.4 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.43 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.05 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.44 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.39 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.58 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  39.34 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  36.44 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  37.04 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  27.25 
 
 		 400 aa  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0655  hypothetical protein  72.83 
 
 		 96 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000822696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  26.99 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.69 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.05 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.39 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  29.43 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.79 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.43 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 926 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 		 913 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 913 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 892 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 924 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 882 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 892 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.21 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 914 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 907 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 		 926 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 892 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.4 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 892 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.96 
 
 		 243 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 889 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 925 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 926 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.51 
 
 		 234 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 865 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 915 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 		 916 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 883 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  31.63 
 
 		 236 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.63 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.63 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.09 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 910 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.23 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.72 
 
 		 236 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.72 
 
 		 236 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.09 
 
 		 236 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.72 
 
 		 249 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.39 
 
 		 856 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.67 
 
 		 236 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  32.16 
 
 		 236 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 923 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.94 
 
 		 265 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.71 
 
 		 236 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  24.45 
 
 		 859 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  27.21 
 
 		 892 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.06 
 
 		 232 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.49 
 
 		 246 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.2 
 
 		 239 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 913 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 899 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 		 923 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.81 
 
 		 233 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 896 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.5 
 
 		 239 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 892 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  26.69 
 
 		 904 aa  97.1  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 900 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.38 
 
 		 239 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  24.24 
 
 		 872 aa  95.1  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.91 
 
 		 238 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 886 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  24.63 
 
 		 886 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 863 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.33 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.97 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.83 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 		 886 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  24.19 
 
 		 872 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2551  alanyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 870 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_50  alanyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 876 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000334801  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.49 
 
 		 238 aa  90.5  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 		 888 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2952  alanyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 883 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.57 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 874 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>