More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4220 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  100 
 
 
408 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  94.4 
 
 
406 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  94.15 
 
 
406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  67.9 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43 
 
 
408 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.13 
 
 
387 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33.08 
 
 
411 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.41 
 
 
400 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.17 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33.17 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  33.17 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.97 
 
 
389 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.58 
 
 
411 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.83 
 
 
400 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  33 
 
 
400 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.83 
 
 
400 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.73 
 
 
403 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.5 
 
 
400 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.9 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  31.18 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  29.95 
 
 
400 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  29.95 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.59 
 
 
398 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
926 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.16 
 
 
390 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
924 aa  150  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
926 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
925 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 
913 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
913 aa  143  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
926 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
915 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.56 
 
 
373 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  28.36 
 
 
892 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
923 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
916 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
892 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.56 
 
 
373 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
884 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
888 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 
892 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
892 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
893 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 
882 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
914 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.45 
 
 
373 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
923 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 
874 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
896 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
874 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.74 
 
 
265 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  34.51 
 
 
430 aa  123  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 
897 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 
897 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
874 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
874 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
899 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
892 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
897 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
913 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.97 
 
 
369 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 
884 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 
910 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.89 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 
872 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 
874 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 
874 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.41 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
889 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
892 aa  116  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
872 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  40.24 
 
 
249 aa  116  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  33.18 
 
 
900 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.69 
 
 
239 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
892 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
874 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
900 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  22.82 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 
883 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 
874 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
863 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
874 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 
872 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 
865 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 
877 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
874 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
878 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
876 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
880 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 
872 aa  106  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
880 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 
880 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
884 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>