More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1201 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1201  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  100 
 
 		 399 aa  785    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.59 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 913 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 892 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.09 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 896 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 916 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 907 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 892 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.13 
 
 		 408 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 892 aa  119  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.84 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 913 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 914 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.66 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  25.31 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  34.17 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  27.96 
 
 		 892 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 923 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 868 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 892 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1021  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.82 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  24.38 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 865 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 		 865 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 926 aa  103  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27.73 
 
 		 892 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  34.84 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 915 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1113  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.2 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.466733  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 904 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 923 aa  99.8  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 883 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  25.74 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1099  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.55 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.239872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 		 910 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  26.57 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 889 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  26.17 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.8 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 892 aa  97.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  25.25 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 		 924 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.02 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  25.25 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  25 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  25 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.24 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 865 aa  96.3  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 874 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 871 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 897 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 897 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 874 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  25.18 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 874 aa  93.6  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 874 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 925 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 		 875 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 874 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 874 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 874 aa  93.2  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 874 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 874 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 897 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 874 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 882 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 874 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.88 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 899 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 913 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 		 874 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0028  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 		 868 aa  91.3  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 		 874 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 874 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 874 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 877 aa  90.5  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 874 aa  90.5  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.04 
 
 		 864 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 887 aa  89.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 876 aa  90.1  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 		 856 aa  89.7  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 875 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000779189 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.86 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 865 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 874 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 874 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 874 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 926 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 874 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 900 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 		 892 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 876 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 888 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 880 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 893 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 		 890 aa  87  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 872 aa  87  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.53 
 
 		 265 aa  86.3  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>