More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3878 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 885 aa  1802    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 		 890 aa  914    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 897 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 895 aa  891    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 904 aa  903    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 878 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 892 aa  1067    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 876 aa  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 893 aa  996    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 895 aa  844    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 889 aa  891    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 889 aa  867    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 879 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  57.16 
 
 		 898 aa  933    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  48.04 
 
 		 894 aa  769    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 880 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 896 aa  786    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 897 aa  1047    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 892 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 881 aa  831    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 900 aa  877    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 888 aa  912    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 890 aa  1030    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 878 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 893 aa  772    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 895 aa  867    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 891 aa  1016    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  53.18 
 
 		 890 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 888 aa  840    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 897 aa  931    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 889 aa  879    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 903 aa  854    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 897 aa  811    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  60.02 
 
 		 892 aa  1066    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 892 aa  899    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 886 aa  833    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 896 aa  942    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 889 aa  819    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 897 aa  931    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 898 aa  941    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 893 aa  845    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 902 aa  839    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 898 aa  900    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 883 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 880 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 876 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 882 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 875 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 883 aa  621  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 879 aa  619  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 882 aa  620  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 879 aa  621  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 891 aa  619  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 878 aa  617  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 891 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 877 aa  613  9.999999999999999e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 891 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 874 aa  612  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 878 aa  612  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 880 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 878 aa  612  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 892 aa  608  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 896 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 905 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 886 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 905 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 887 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 874 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 874 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 902 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 887 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 874 aa  599  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 874 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 874 aa  602  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1038  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 878 aa  597  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 874 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 905 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 897 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 897 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 886 aa  595  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 897 aa  595  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 880 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 887 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 879 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 879 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 889 aa  594  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 905 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 874 aa  592  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 884 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 895 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  39.82 
 
 		 876 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 879 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 876 aa  591  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 877 aa  591  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>