More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1054 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  513  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  99.19 
 
 
247 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  87.04 
 
 
247 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  72.43 
 
 
249 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  72.08 
 
 
245 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  69.2 
 
 
245 aa  348  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  68.35 
 
 
245 aa  344  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
239 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  47.88 
 
 
239 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  47.88 
 
 
239 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
246 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  47.06 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  42.98 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  42.86 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  43.9 
 
 
243 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  44.53 
 
 
243 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.5 
 
 
243 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
255 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  44.31 
 
 
243 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.84 
 
 
236 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  44.31 
 
 
243 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.57 
 
 
243 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.9 
 
 
243 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.8 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.8 
 
 
249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  41.9 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
250 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42 
 
 
250 aa  195  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.22 
 
 
239 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  41.1 
 
 
245 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  42.28 
 
 
243 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  42.28 
 
 
243 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  42.28 
 
 
243 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  42.28 
 
 
243 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
243 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  41.87 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.33 
 
 
240 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  36.44 
 
 
236 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.17 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.21 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  35.54 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.7 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.71 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.71 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.67 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.39 
 
 
243 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  35.12 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  35.12 
 
 
236 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  34.3 
 
 
236 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.71 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  35 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.3 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.02 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.47 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.78 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.35 
 
 
240 aa  115  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.06 
 
 
238 aa  113  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.95 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.12 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
892 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.77 
 
 
235 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.23 
 
 
246 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
896 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.75 
 
 
244 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.37 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
892 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.75 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.63 
 
 
408 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1118  alanyl-tRNA synthetase  31.07 
 
 
857 aa  92  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 
900 aa  91.7  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
892 aa  90.1  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
899 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.91 
 
 
398 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.99 
 
 
411 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.66 
 
 
414 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.68 
 
 
403 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.67 
 
 
387 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.12 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
916 aa  85.5  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  32.51 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.39 
 
 
401 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
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NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
904 aa  82.4  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  31.73 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  33 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  33 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  33 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  33 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
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NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.37 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
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NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  31.06 
 
 
882 aa  80.1  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
925 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
924 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1375  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.6 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0902986  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0961  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.6 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0417  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.6 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0225  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.6 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0319301  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1785  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  30.6 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.170383  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1871  putative alanyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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