More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1402 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  99.59 
 
 
243 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  99.59 
 
 
243 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  99.59 
 
 
243 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  98.77 
 
 
243 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  98.35 
 
 
243 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  80.25 
 
 
243 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  79.42 
 
 
243 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  79.42 
 
 
243 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  80.25 
 
 
243 aa  387  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  79.42 
 
 
243 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  78.19 
 
 
243 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  78.6 
 
 
243 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  78.6 
 
 
243 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  59.02 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  56 
 
 
252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  52.8 
 
 
250 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
255 aa  235  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  44.58 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.36 
 
 
239 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  46.75 
 
 
249 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.08 
 
 
245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  47.93 
 
 
236 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  47.74 
 
 
238 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  47.54 
 
 
239 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
245 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  47.35 
 
 
245 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  42.28 
 
 
247 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  41.87 
 
 
247 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
239 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  44.9 
 
 
237 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  42.32 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  46.77 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  45.56 
 
 
239 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  45.56 
 
 
239 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
246 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  40.89 
 
 
232 aa  165  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.75 
 
 
240 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.48 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  37.2 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  34.14 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.88 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  32.1 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  32.1 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  32.1 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.27 
 
 
238 aa  125  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.33 
 
 
233 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.69 
 
 
236 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.33 
 
 
238 aa  122  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  30.86 
 
 
236 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.28 
 
 
236 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.14 
 
 
238 aa  121  8e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  31.28 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  30.86 
 
 
236 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  31.12 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.33 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.17 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.48 
 
 
236 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.33 
 
 
398 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
904 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.71 
 
 
238 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  33.86 
 
 
249 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  27.76 
 
 
236 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.63 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
900 aa  96.7  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
878 aa  95.9  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.07 
 
 
265 aa  95.1  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0971  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.88 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
882 aa  92  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.01 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
872 aa  89.4  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.74 
 
 
246 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.2 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
892 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
910 aa  86.7  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.39 
 
 
387 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
862 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
881 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 
896 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.6 
 
 
403 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 
892 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
892 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
892 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.76 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 
880 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.11 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.06 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.16 
 
 
411 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.16 
 
 
400 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.16 
 
 
411 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  28.16 
 
 
411 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  28.16 
 
 
411 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.63 
 
 
408 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
892 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
889 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
880 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 
899 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
926 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>