More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3806 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
246 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  73.03 
 
 
244 aa  358  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  48.5 
 
 
236 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.41 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.08 
 
 
238 aa  155  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.9 
 
 
233 aa  155  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  51.59 
 
 
255 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  39.83 
 
 
238 aa  153  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.44 
 
 
235 aa  152  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  40.25 
 
 
238 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  42.26 
 
 
239 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  40.66 
 
 
238 aa  145  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  40.59 
 
 
239 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  41.84 
 
 
239 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.91 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  35 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  35.59 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  35.15 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.73 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.73 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  35.59 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
246 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  34.31 
 
 
236 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  34.73 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  34.73 
 
 
236 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  34.75 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  38.53 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.37 
 
 
243 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.47 
 
 
242 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
239 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  39.75 
 
 
236 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0961  alanyl-tRNA synthetase-related protein  40 
 
 
239 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0225  alanyl-tRNA synthetase-related protein  40 
 
 
239 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0319301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1375  alanyl-tRNA synthetase-related protein  40 
 
 
239 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0902986  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0417  alanyl-tRNA synthetase-related protein  40 
 
 
239 aa  121  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0336  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  40.53 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1785  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  40.53 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.170383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1871  putative alanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.51 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  38.7 
 
 
245 aa  118  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.19 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  37.12 
 
 
240 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
237 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.43 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.84 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.5 
 
 
239 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  36.33 
 
 
249 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5692  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  38.97 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.31 
 
 
238 aa  111  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.5 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
892 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.47 
 
 
247 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.06 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.4 
 
 
238 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.32 
 
 
239 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
255 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  32.23 
 
 
247 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
892 aa  105  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  31.82 
 
 
247 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.05 
 
 
245 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
892 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
896 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.91 
 
 
249 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
907 aa  101  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 
899 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.34 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  33.49 
 
 
404 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.54 
 
 
249 aa  98.6  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0971  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.16 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.45 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.69 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.69 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.47 
 
 
403 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30 
 
 
408 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 
904 aa  89.7  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.72 
 
 
403 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.61 
 
 
387 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.12 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.06 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
916 aa  85.9  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.24 
 
 
243 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.51 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
882 aa  85.5  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
913 aa  85.5  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
914 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 
913 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  31.28 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  31.28 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  31.28 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  32.1 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  26.77 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  31.71 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.69 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.57 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
915 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.06 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
900 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>