More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4455 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
255 aa  510  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  78.31 
 
 
250 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  77.91 
 
 
250 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  71.49 
 
 
249 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  69.05 
 
 
252 aa  348  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  54.03 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  55.24 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  55.24 
 
 
243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  54.44 
 
 
243 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  52.82 
 
 
243 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  52.02 
 
 
243 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
243 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  54.03 
 
 
243 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  54.03 
 
 
243 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  54.03 
 
 
243 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  54.03 
 
 
243 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  51.61 
 
 
243 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  53.63 
 
 
243 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  47.93 
 
 
249 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
239 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  50.61 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  48.59 
 
 
238 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
245 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45 
 
 
245 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  43.44 
 
 
245 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  50 
 
 
239 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  50.2 
 
 
239 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  42.8 
 
 
247 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.16 
 
 
236 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
246 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  42.4 
 
 
247 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  48.16 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  48.16 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  49.6 
 
 
239 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  49.6 
 
 
245 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.94 
 
 
247 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  41.8 
 
 
240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  35.34 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.06 
 
 
236 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.06 
 
 
236 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  32.65 
 
 
236 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.73 
 
 
243 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  31.15 
 
 
236 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.65 
 
 
236 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  33.06 
 
 
236 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.06 
 
 
236 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  32.65 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
892 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.73 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.64 
 
 
236 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.24 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
899 aa  116  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.54 
 
 
238 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 
892 aa  115  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.27 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
896 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.05 
 
 
234 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  35.83 
 
 
236 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.43 
 
 
242 aa  111  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.13 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
892 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
900 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.19 
 
 
246 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
904 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  33.06 
 
 
240 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.14 
 
 
238 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.1 
 
 
244 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  32 
 
 
882 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  33.33 
 
 
238 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.64 
 
 
252 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  34.65 
 
 
249 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.21 
 
 
255 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.1 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
907 aa  99  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
881 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.96 
 
 
408 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
913 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
878 aa  89  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
876 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
854 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.82 
 
 
237 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.13 
 
 
398 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
889 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
916 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
876 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 
875 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
874 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 
925 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
926 aa  82  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
883 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.07 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
915 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0971  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.51 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 
914 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.6 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
872 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 
874 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0534  alanyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 
842 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>