More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4712 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 		 403 aa  792    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  44.21 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.96 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2655  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.32 
 
 		 285 aa  222  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 892 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 892 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 892 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 892 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 923 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 913 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 900 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 916 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 		 923 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 864 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 882 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 865 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 926 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 914 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 904 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 879 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 925 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 874 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 870 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 882 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 926 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 876 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 926 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 872 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 		 883 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 865 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 913 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 889 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 924 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 880 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 874 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 892 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 868 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 		 885 aa  127  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 		 872 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 880 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 876 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 880 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 880 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 876 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.72 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 888 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 880 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 877 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 877 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 876 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 880 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 913 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 880 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 880 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 880 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 880 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 886 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 907 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 896 aa  123  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 885 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 877 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 865 aa  122  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 910 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 880 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 876 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 891 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 874 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.23 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 876 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 876 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 876 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 876 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 879 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 876 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 876 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 879 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 876 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 876 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 		 859 aa  121  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 876 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 		 875 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.09 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 876 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  26.36 
 
 		 876 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 879 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  27.32 
 
 		 876 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 876 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 		 876 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 880 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 		 879 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 874 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 876 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 		 876 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 874 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 874 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 899 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.53 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 865 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 874 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 890 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>