More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2655 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2655  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  63.12 
 
 
446 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  48.45 
 
 
432 aa  231  8.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.68 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 
913 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.94 
 
 
411 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.6 
 
 
414 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.47 
 
 
400 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
892 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.5 
 
 
236 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  31.23 
 
 
925 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 
892 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
892 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
900 aa  93.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
896 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
923 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.24 
 
 
411 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
926 aa  93.2  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  29.24 
 
 
411 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  29.24 
 
 
411 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.24 
 
 
400 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.24 
 
 
411 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.62 
 
 
408 aa  92  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 
892 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 
886 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
899 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.47 
 
 
400 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.74 
 
 
400 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 
882 aa  90.5  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 
926 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
892 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
891 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
886 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.1 
 
 
400 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
883 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.04 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
892 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.94 
 
 
408 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
904 aa  86.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  34.57 
 
 
401 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  25.35 
 
 
910 aa  85.9  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0534  alanyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
842 aa  85.5  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0613  alanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
842 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.79 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
891 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  29.23 
 
 
891 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1072  alanyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 
845 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.41 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1429  alanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
842 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  27.88 
 
 
891 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1029  alanyl-tRNA synthetase  24.81 
 
 
845 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00361534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  32.54 
 
 
406 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  26.67 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
884 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0493  alanyl-tRNA synthetase  29.52 
 
 
872 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 
892 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 
882 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  27.03 
 
 
876 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
926 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 
900 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.34 
 
 
859 aa  80.1  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 
898 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
913 aa  79.7  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 
885 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
893 aa  79.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  30.3 
 
 
898 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
924 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
893 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.54 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  30.38 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  28.88 
 
 
914 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 
894 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 
905 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
916 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  31.97 
 
 
931 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  27.5 
 
 
906 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 
880 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
904 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 
913 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
878 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4081  alanyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
884 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
895 aa  76.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
888 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 
874 aa  75.5  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 
913 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
897 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  28.95 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
885 aa  75.1  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
897 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
897 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 
890 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.4 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3983  alanyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
1098 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 
848 aa  73.9  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  25.19 
 
 
864 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 
887 aa  73.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  31.15 
 
 
915 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
879 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
875 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2551  alanyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
870 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>