More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0156 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 876 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 876 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0728  alanyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 886 aa  711    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.846267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 865 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 874 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 874 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 877 aa  755    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 874 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 875 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 892 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 897 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 885 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 874 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 874 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 874 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 903 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 860 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 860 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 899 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 890 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 887 aa  679    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 863 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 874 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0146  alanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 891 aa  702    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00216765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 874 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 891 aa  708    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 874 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 872 aa  636    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 876 aa  643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 883 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 897 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 874 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 876 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 874 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 864 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 892 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 860 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 876 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 874 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 901 aa  719    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2818  alanyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 883 aa  660    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0508  alanyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 887 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 885 aa  735    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 883 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 891 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 881 aa  698    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 848 aa  1753    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0981  alanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 887 aa  702    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 884 aa  666    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 887 aa  750    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 875 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 890 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 876 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 874 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 874 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 874 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 891 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 886 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 897 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 890 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 884 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 913 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 902 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1720  alanyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 884 aa  712    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 897 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 892 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 865 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 909 aa  719    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4081  alanyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 884 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 874 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 883 aa  669    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 874 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 874 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 869 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 885 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 884 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 874 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 874 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 897 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 891 aa  684    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 878 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 874 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 896 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 883 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 885 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1038  alanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 878 aa  685    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 900 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 892 aa  690    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 876 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 875 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>