More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2640 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 878 aa  648    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 892 aa  902    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 		 892 aa  909    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 892 aa  858    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 897 aa  937    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 889 aa  926    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 890 aa  1078    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 898 aa  916    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  89.09 
 
 		 897 aa  1558    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 896 aa  741    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 903 aa  856    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 897 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 880 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 902 aa  798    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 885 aa  972    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 881 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  82.5 
 
 		 904 aa  1460    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 881 aa  835    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  46.84 
 
 		 894 aa  740    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 895 aa  778    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 879 aa  653    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  51.22 
 
 		 890 aa  803    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 878 aa  638    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 895 aa  844    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 900 aa  1192    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 891 aa  1077    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  89.2 
 
 		 897 aa  1561    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 880 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 		 890 aa  1202    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 893 aa  740    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 889 aa  862    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 888 aa  894    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  89.64 
 
 		 898 aa  1554    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 889 aa  853    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 893 aa  848    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 893 aa  914    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 892 aa  930    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 889 aa  861    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 888 aa  992    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 886 aa  820    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 896 aa  860    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  89.2 
 
 		 897 aa  1561    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 898 aa  1817    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 895 aa  854    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 876 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 879 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 879 aa  626  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 891 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 891 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 891 aa  625  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 886 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 884 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 886 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 879 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 877 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 878 aa  617  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 878 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 882 aa  616  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 877 aa  618  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 883 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 892 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 887 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 874 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 874 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 892 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 879 aa  612  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 903 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 864 aa  608  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 876 aa  605  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 876 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 865 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 876 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  40.07 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 896 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 860 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 882 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 891 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 879 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 887 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 902 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 869 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 876 aa  602  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 889 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 865 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 874 aa  598  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 900 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 874 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>