More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3983 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3983  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1098 aa  2264    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
904 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 
905 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
905 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
905 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
876 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
875 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
878 aa  493  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 
875 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
875 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 
879 aa  483  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  59.65 
 
 
882 aa  482  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
876 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 
876 aa  482  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 
880 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 
903 aa  475  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
876 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
876 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  55.88 
 
 
876 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
876 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
876 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
875 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
876 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
876 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
876 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
876 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 
874 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
874 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
874 aa  469  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 
878 aa  469  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
892 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
879 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
876 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
876 aa  466  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
876 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
876 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
876 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 
874 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 
880 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
879 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
874 aa  462  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
892 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 
881 aa  459  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 
875 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
890 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 
884 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 
880 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  54 
 
 
865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
874 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
897 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
899 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
890 aa  456  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
897 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
875 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
865 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
874 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
874 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
896 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
897 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
874 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
874 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
874 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
874 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
874 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
874 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
874 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
874 aa  452  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
874 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
874 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 
874 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
874 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
874 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 
875 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
875 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
897 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
874 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
897 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
877 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
860 aa  446  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
897 aa  446  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
860 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 
875 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
865 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
890 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 
869 aa  446  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
874 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
863 aa  446  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
885 aa  446  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
877 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
860 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
871 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
875 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
864 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
875 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
874 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
890 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
875 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 
874 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
860 aa  439  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 
872 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>