More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1689 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 890 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  64.63 
 
 		 902 aa  1143    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 		 890 aa  789    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 891 aa  827    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 903 aa  872    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 900 aa  754    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 895 aa  1178    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 893 aa  862    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 892 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 889 aa  868    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 893 aa  969    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 897 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  56.86 
 
 		 894 aa  956    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 880 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  53.07 
 
 		 890 aa  802    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 881 aa  811    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 888 aa  839    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 889 aa  842    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 892 aa  894    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 		 895 aa  1105    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 904 aa  725    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 885 aa  855    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 897 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 889 aa  940    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 898 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 888 aa  841    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 889 aa  820    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 895 aa  1781    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 897 aa  895    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 898 aa  912    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 892 aa  890    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 892 aa  904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 886 aa  874    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  68.95 
 
 		 896 aa  1112    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 896 aa  900    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 897 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  73.8 
 
 		 897 aa  1217    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 898 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  58.92 
 
 		 893 aa  986    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 878 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 878 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 876 aa  625  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 876 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 889 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 884 aa  612  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 882 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 878 aa  608  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 876 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 886 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 897 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 886 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 874 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 897 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 878 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 880 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4508  alanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 880 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 892 aa  602  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 880 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 883 aa  602  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 878 aa  601  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 874 aa  599  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 879 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 880 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 880 aa  596  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 880 aa  596  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 880 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 874 aa  598  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 880 aa  598  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 897 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 880 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 886 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 880 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 874 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 880 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 876 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 874 aa  595  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 880 aa  595  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 877 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 904 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 879 aa  592  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 876 aa  594  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 878 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 882 aa  593  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 905 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 880 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 874 aa  592  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 874 aa  592  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 889 aa  591  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 905 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 874 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 874 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 879 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 905 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 890 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 874 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>