More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2298 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  58.49 
 
 
213 aa  270  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1334  putative alanyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 
213 aa  245  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2987  metal-dependent hydrolase  52.36 
 
 
226 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4713  alanyl tRNA synthetase-related protein  52.15 
 
 
212 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.601356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  50 
 
 
214 aa  223  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0131  hypothetical protein  47.37 
 
 
224 aa  205  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0641212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0660  hypothetical protein  49.28 
 
 
214 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0644  hypothetical protein  48.8 
 
 
221 aa  201  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  45.37 
 
 
218 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.58 
 
 
403 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  32.1 
 
 
245 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.05 
 
 
236 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.05 
 
 
236 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  30.67 
 
 
262 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.89 
 
 
446 aa  98.2  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  33.05 
 
 
236 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  33.47 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  30.71 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  33.05 
 
 
236 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 
910 aa  93.2  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
892 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  30.25 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  33.05 
 
 
236 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.45 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.17 
 
 
239 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.64 
 
 
236 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.64 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.64 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.87 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 
892 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.47 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.09 
 
 
236 aa  89.4  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 
892 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.3 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  29.83 
 
 
263 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
239 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  30.21 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 
246 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
892 aa  85.5  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
892 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.65 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.16 
 
 
238 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.45 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 
914 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.29 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
896 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.99 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 
898 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.4 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.53 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
882 aa  79.7  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.25 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.88 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
245 aa  79  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.1 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.54 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
900 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.69 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  28.9 
 
 
904 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.1 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.76 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.8 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 
892 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.76 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 
913 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  28.38 
 
 
878 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.08 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  29.87 
 
 
913 aa  75.9  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  31.36 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  31.36 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  25.66 
 
 
404 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.78 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2655  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.4 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  26.32 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
848 aa  74.7  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.63 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.82 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.06 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.24 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.32 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 
889 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.88 
 
 
243 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 
923 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 
888 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.32 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.32 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.19 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.19 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.19 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 
916 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
886 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 
881 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.38 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.96 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
892 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>