More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4323 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  72.9 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  72.52 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  72.52 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  32.19 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 910 aa  92  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.83 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.31 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.34 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.62 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2987  metal-dependent hydrolase  30.64 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1334  putative alanyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  30.04 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 900 aa  82  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.34 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.24 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.24 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 904 aa  79  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.72 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.46 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.13 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 892 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 892 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.69 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 892 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0660  hypothetical protein  29.06 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 926 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0131  hypothetical protein  27.71 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0641212  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 925 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 892 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 926 aa  72.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0644  hypothetical protein  29.06 
 
 		 221 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.85 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 923 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  28.4 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.8 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.41 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 913 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 899 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 924 aa  68.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 926 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.04 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 923 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 892 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.12 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.98 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 		 878 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  27.2 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  26.24 
 
 		 896 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4713  alanyl tRNA synthetase-related protein  27.12 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.601356  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  25.71 
 
 		 907 aa  65.5  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.23 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 889 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  27.5 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 937 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 848 aa  64.7  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  30.47 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  25.3 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  25.87 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.8 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.16 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  29.3 
 
 		 878 aa  62.4  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 863 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 		 860 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.31 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 865 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 872 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  27.56 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.58 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.17 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  25.23 
 
 		 885 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  27.56 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  27.56 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.95 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.82 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0205  alanyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 884 aa  60.1  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 867 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.1 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.8 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 876 aa  58.9  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 859 aa  58.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.03 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.38 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.95 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  27.09 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 902 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 882 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 867 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 882 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 863 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  24.53 
 
 		 892 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0971  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.78 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>