More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4713 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4713  alanyl tRNA synthetase-related protein  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.601356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  52.15 
 
 
212 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  51.67 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0660  hypothetical protein  46.23 
 
 
214 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0644  hypothetical protein  46.7 
 
 
221 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  47.85 
 
 
214 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2987  metal-dependent hydrolase  47.39 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1334  putative alanyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0131  hypothetical protein  47.17 
 
 
224 aa  198  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0641212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  43.06 
 
 
218 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.27 
 
 
387 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.58 
 
 
236 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.47 
 
 
232 aa  89  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.18 
 
 
403 aa  88.2  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
892 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  27.95 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
892 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 
910 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.49 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.74 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.88 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
900 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
892 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
892 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.25 
 
 
236 aa  79  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.38 
 
 
400 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.17 
 
 
411 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.17 
 
 
411 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.26 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  28.38 
 
 
411 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  28.38 
 
 
411 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.12 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.13 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.51 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.77 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.39 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  25.55 
 
 
892 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.39 
 
 
414 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.16 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.09 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.31 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.09 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
913 aa  75.5  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.96 
 
 
400 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
892 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.73 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  26.09 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.74 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
904 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
892 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.35 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  27.9 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.22 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.74 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 
896 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  27.04 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 
926 aa  73.2  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.82 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  27.47 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  26.52 
 
 
236 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.61 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.61 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  26.09 
 
 
236 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.07 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  26.52 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  27.16 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.26 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.98 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.54 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  28 
 
 
899 aa  69.7  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2655  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.61 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  25.35 
 
 
400 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 
882 aa  68.6  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.09 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.71 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  26.78 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.51 
 
 
237 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  26.09 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.12 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 
889 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.82 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.82 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  27.12 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  25.55 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.55 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.09 
 
 
390 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 
923 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  24.78 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
913 aa  65.5  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
925 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  24.78 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  24.78 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.89 
 
 
398 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  24.78 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>