292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0131 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0131  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0641212  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0644  hypothetical protein  60.19 
 
 
221 aa  261  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0660  hypothetical protein  59.72 
 
 
214 aa  261  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  55.02 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2987  metal-dependent hydrolase  48.83 
 
 
226 aa  215  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1334  putative alanyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
213 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  47.37 
 
 
212 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4713  alanyl tRNA synthetase-related protein  47.17 
 
 
212 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.601356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  47.62 
 
 
213 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  47.22 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 
892 aa  88.6  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 
910 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
892 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.83 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.95 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  26.67 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.38 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.63 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  27.51 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
892 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.82 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
892 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.19 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.29 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.43 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  24.05 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 
904 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.58 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  27.71 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  27 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.81 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  27.47 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  27.47 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  27.83 
 
 
234 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.11 
 
 
390 aa  72  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  23.74 
 
 
387 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  23.63 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
900 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.63 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.97 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  26.97 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.73 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  23.21 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.68 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.85 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.39 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  23.21 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  23.21 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
878 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.27 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.43 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  26.05 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  22.78 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.47 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  27.43 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.47 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  25.93 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1156  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  22.66 
 
 
446 aa  65.9  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0609715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  27.43 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
913 aa  65.1  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  27.16 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  23.75 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  23.75 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  24.89 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  24.09 
 
 
404 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  23.5 
 
 
398 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  23.53 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  25.7 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  27.16 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.12 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.1 
 
 
389 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  24.05 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.51 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.94 
 
 
245 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  24.05 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
913 aa  61.6  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  22.31 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  24.48 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  23.71 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 
890 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
913 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  25.84 
 
 
411 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  25.84 
 
 
411 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  22.84 
 
 
238 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  25.65 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  25.84 
 
 
400 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  22.51 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  25.84 
 
 
411 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  25.84 
 
 
411 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 
886 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  24.88 
 
 
400 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  26.54 
 
 
891 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
886 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  24.06 
 
 
400 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  24.4 
 
 
400 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  22.27 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  24.79 
 
 
882 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>