More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2278 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 888 aa  882    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 893 aa  875    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  54.54 
 
 		 890 aa  934    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 895 aa  888    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  56.38 
 
 		 891 aa  956    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 		 893 aa  995    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 889 aa  910    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 902 aa  901    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 890 aa  959    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 904 aa  877    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 879 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 892 aa  905    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 889 aa  937    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 888 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 885 aa  887    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 893 aa  971    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 881 aa  810    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 		 897 aa  893    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 897 aa  1009    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 897 aa  861    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 896 aa  847    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  67.79 
 
 		 903 aa  1180    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 895 aa  943    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 892 aa  910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 897 aa  895    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 878 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 898 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 900 aa  900    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 889 aa  867    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 889 aa  885    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 880 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 892 aa  1813    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 895 aa  943    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 886 aa  844    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 896 aa  857    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 897 aa  895    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  52.74 
 
 		 890 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 898 aa  892    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  52.13 
 
 		 894 aa  853    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 892 aa  831    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  90.02 
 
 		 898 aa  1628    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 876 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 880 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 876 aa  631  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 874 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 879 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 879 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 874 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 874 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 860 aa  629  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 889 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 876 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 874 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 874 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 874 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 876 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  41.22 
 
 		 876 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 865 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 877 aa  625  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 874 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 860 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 878 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 874 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 865 aa  625  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 876 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 874 aa  623  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 877 aa  625  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 897 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 874 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 882 aa  622  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 876 aa  621  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 876 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 860 aa  622  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 886 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 883 aa  621  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 897 aa  622  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 886 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 879 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 897 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  622  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 875 aa  618  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 892 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 876 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 874 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 874 aa  617  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 889 aa  617  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 875 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 876 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 867 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 874 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>