More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0125 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
872 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0125  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
875 aa  1816    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
874 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
874 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
876 aa  638    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
867 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
874 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
865 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
892 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
897 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
874 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
860 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
874 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
874 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
875 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
876 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
874 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
860 aa  653    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
860 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
899 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
890 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
901 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
874 aa  656    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
856 aa  653    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
874 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
876 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
874 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
874 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 
882 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
897 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
874 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
876 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
876 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
880 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
864 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  41.51 
 
 
876 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
874 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
897 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
863 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
881 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
874 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
876 aa  680    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
874 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
874 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
875 aa  643    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
875 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
874 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
875 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
876 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
890 aa  665    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
884 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
865 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
874 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 
903 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
897 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
865 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
874 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
860 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
897 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
874 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
874 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
874 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
874 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
875 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
874 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
874 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
897 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
878 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
874 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
874 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
876 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
876 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
876 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
874 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
892 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 
875 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
874 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
865 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
877 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
865 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
874 aa  633  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
895 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
877 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
876 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
889 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
885 aa  635  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
875 aa  634  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000779189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
874 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
874 aa  630  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
874 aa  630  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
931 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
878 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
900 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>