166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0956 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  78.39 
 
 		 686 aa  1125    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  75.08 
 
 		 992 aa  1545    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  61.99 
 
 		 992 aa  1258    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  67.14 
 
 		 1004 aa  1355    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  100 
 
 		 986 aa  2023    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73.71 
 
 		 986 aa  1514    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  74.01 
 
 		 986 aa  1514    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  34.6 
 
 		 984 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.8 
 
 		 1017 aa  396  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.22 
 
 		 981 aa  383  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  33.12 
 
 		 1008 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.01 
 
 		 1003 aa  343  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  32.34 
 
 		 1097 aa  282  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  31.85 
 
 		 1056 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  32.33 
 
 		 1096 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  32.25 
 
 		 1055 aa  227  9e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.14 
 
 		 1618 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  25.89 
 
 		 1685 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  26.37 
 
 		 1685 aa  111  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  24.55 
 
 		 1651 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.88 
 
 		 1617 aa  107  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.96 
 
 		 1621 aa  106  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1119 aa  107  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.03 
 
 		 1613 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18860  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25.48 
 
 		 1621 aa  105  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  26.23 
 
 		 1595 aa  104  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  23.71 
 
 		 1630 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  24.66 
 
 		 1614 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.97 
 
 		 1642 aa  103  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1119 aa  102  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.77 
 
 		 1613 aa  101  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  23.95 
 
 		 1622 aa  101  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  24.13 
 
 		 1617 aa  101  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  23.53 
 
 		 1613 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  24.41 
 
 		 1622 aa  100  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.16 
 
 		 1612 aa  100  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.24 
 
 		 1617 aa  100  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  25.54 
 
 		 1610 aa  100  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  23.55 
 
 		 1614 aa  99.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  23.38 
 
 		 1591 aa  99.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  23.33 
 
 		 1638 aa  99  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  28.61 
 
 		 1609 aa  99  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  23.33 
 
 		 1638 aa  99  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.43 
 
 		 1614 aa  98.6  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.83 
 
 		 1643 aa  98.2  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  25.97 
 
 		 1601 aa  97.8  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  23.68 
 
 		 1585 aa  97.8  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  23.18 
 
 		 1674 aa  97.8  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.96 
 
 		 1613 aa  97.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.35 
 
 		 1614 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.35 
 
 		 1614 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  23.38 
 
 		 1613 aa  97.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  23.96 
 
 		 1614 aa  97.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  24 
 
 		 1605 aa  97.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.62 
 
 		 1550 aa  96.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  25.42 
 
 		 1590 aa  96.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  24.91 
 
 		 1620 aa  96.3  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1122 aa  95.5  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  24.15 
 
 		 1614 aa  95.5  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  22.9 
 
 		 1613 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  24.91 
 
 		 1620 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  22.9 
 
 		 1613 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  22.9 
 
 		 1613 aa  95.1  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.72 
 
 		 1625 aa  94.7  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  23.95 
 
 		 1614 aa  94.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  25.21 
 
 		 1646 aa  94.7  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.68 
 
 		 1623 aa  94.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  24.79 
 
 		 1634 aa  94  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  23.9 
 
 		 1614 aa  93.2  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.86 
 
 		 1586 aa  92.8  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  24.2 
 
 		 1615 aa  92.8  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.09 
 
 		 1582 aa  92  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.81 
 
 		 1628 aa  92  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.01 
 
 		 1616 aa  92  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1382 aa  92  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  23.92 
 
 		 1663 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  23.92 
 
 		 1621 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1625 aa  91.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.68 
 
 		 1583 aa  91.7  7e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  23.3 
 
 		 1621 aa  91.3  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  23.24 
 
 		 1613 aa  91.3  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  22.91 
 
 		 1618 aa  90.5  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  24.05 
 
 		 1621 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1625 aa  89.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  23.47 
 
 		 1627 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.65 
 
 		 1613 aa  89.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1819  NAD-glutamate dehydrogenase  23.48 
 
 		 1641 aa  89.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  unclonable  0.000181151  decreased coverage  0.00683073 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.69 
 
 		 1584 aa  89.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  23.38 
 
 		 1614 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  23.38 
 
 		 1614 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  23.38 
 
 		 1614 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1614 aa  88.2  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  23.27 
 
 		 1591 aa  88.2  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  22.13 
 
 		 1626 aa  88.2  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  22.88 
 
 		 1615 aa  87.8  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  24.06 
 
 		 1642 aa  87.8  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1600 aa  87.8  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1600 aa  87.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1618 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  23.24 
 
 		 1614 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>