150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0315 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  46.06 
 
 
1614 aa  1021    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  43.8 
 
 
1615 aa  885    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  49.28 
 
 
1663 aa  1108    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  41.08 
 
 
1122 aa  732    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  39.88 
 
 
1574 aa  769    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  43.01 
 
 
1550 aa  897    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  46.51 
 
 
1621 aa  1032    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  42.47 
 
 
1600 aa  854    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  47.04 
 
 
1614 aa  1054    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  48.93 
 
 
1618 aa  1093    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  100 
 
 
1119 aa  2318    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  49.15 
 
 
1625 aa  1123    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  99.02 
 
 
1119 aa  2300    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  48.97 
 
 
1625 aa  1120    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  44.39 
 
 
1613 aa  876    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  48.66 
 
 
1618 aa  1088    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1062  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.1 
 
 
1619 aa  884    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.57 
 
 
1617 aa  1035    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.51 
 
 
1613 aa  1051    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  40.66 
 
 
1582 aa  798    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  37.5 
 
 
1594 aa  740    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.34 
 
 
1628 aa  1094    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1831  NAD-specific glutamate dehydrogenase  37.19 
 
 
1598 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.34 
 
 
1613 aa  1030    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  46.24 
 
 
1614 aa  1055    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  46.7 
 
 
1613 aa  1035    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  42.78 
 
 
1625 aa  934    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0211  glutamate dehydrogenase (NAD)  41.1 
 
 
1573 aa  759    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0514  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  37.92 
 
 
1586 aa  773    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.683628  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  40.62 
 
 
1583 aa  791    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  44.34 
 
 
1590 aa  950    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1748  glutamate dehydrogenase (NAD)  44.6 
 
 
1627 aa  1002    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.28 
 
 
1628 aa  1021    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.8 
 
 
1613 aa  1013    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  47.31 
 
 
1614 aa  1030    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.51 
 
 
1612 aa  1065    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1400  NAD-glutamate dehydrogenase  42.84 
 
 
1619 aa  884    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.27 
 
 
1623 aa  995    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2258  NAD-glutamate dehydrogenase  41.37 
 
 
1572 aa  780    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  46.88 
 
 
1613 aa  1030    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.46 
 
 
1619 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.06 
 
 
1618 aa  1092    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  45.26 
 
 
1612 aa  997    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  40.57 
 
 
1586 aa  842    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.19 
 
 
1614 aa  1056    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.19 
 
 
1614 aa  1056    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.58 
 
 
1616 aa  970    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  46.33 
 
 
1615 aa  1018    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  40.85 
 
 
1642 aa  843    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  46.79 
 
 
1613 aa  1035    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  48.44 
 
 
1620 aa  1099    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.19 
 
 
1617 aa  890    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  46.88 
 
 
1613 aa  1030    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1456  glutamate dehydrogenase (NAD)  35.75 
 
 
1623 aa  705    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  46.83 
 
 
1614 aa  1051    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.57 
 
 
1584 aa  935    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.93 
 
 
1639 aa  951    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1592  hypothetical protein  46.59 
 
 
1613 aa  1041    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.62197  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.46 
 
 
1619 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  43.46 
 
 
1595 aa  948    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  43.44 
 
 
1627 aa  901    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  46.88 
 
 
1626 aa  1057    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  43.94 
 
 
1614 aa  895    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  45.68 
 
 
1585 aa  980    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  42.04 
 
 
1569 aa  790    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  42.03 
 
 
1610 aa  887    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  44.5 
 
 
1663 aa  944    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  47.13 
 
 
1614 aa  1053    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  43.46 
 
 
1619 aa  892    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  46.92 
 
 
1614 aa  1048    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  43.8 
 
 
1623 aa  912    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  43.94 
 
 
1685 aa  967    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  46.65 
 
 
1614 aa  1044    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  49.42 
 
 
1613 aa  1115    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  46.15 
 
 
1382 aa  1008    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  46.88 
 
 
1613 aa  1030    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  44.86 
 
 
1622 aa  984    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  40.24 
 
 
1586 aa  759    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  42.57 
 
 
1600 aa  857    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  45.78 
 
 
1553 aa  788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  49.19 
 
 
1621 aa  1108    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1098  NAD-glutamate dehydrogenase  44.31 
 
 
1625 aa  918    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  44.37 
 
 
1624 aa  917    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  42.45 
 
 
1595 aa  833    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  45.04 
 
 
1605 aa  988    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  48.53 
 
 
1620 aa  1102    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  41.2 
 
 
1653 aa  895    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  47.13 
 
 
1614 aa  1055    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  43.3 
 
 
1602 aa  858    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  41.6 
 
 
1611 aa  863    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  48.97 
 
 
1626 aa  1108    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02342  glutamate dehydrogenase  45.62 
 
 
1618 aa  1023    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  46.95 
 
 
1614 aa  1036    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1942  NAD-glutamate dehydrogenase  47.4 
 
 
1614 aa  1012    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  43.55 
 
 
1685 aa  961    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  47.13 
 
 
1614 aa  1053    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  46.52 
 
 
1622 aa  1029    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  49.06 
 
 
1619 aa  1108    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  49.11 
 
 
1621 aa  1107    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  44.22 
 
 
1615 aa  870    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>