253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4376 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  100 
 
 
1003 aa  2011    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  42.34 
 
 
1097 aa  734    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  38.16 
 
 
984 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  37.29 
 
 
981 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  38.54 
 
 
1017 aa  566  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  38.41 
 
 
1008 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  33.01 
 
 
1004 aa  349  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.95 
 
 
992 aa  348  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  33.01 
 
 
986 aa  342  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.82 
 
 
992 aa  340  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  33.54 
 
 
986 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  32.84 
 
 
986 aa  335  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  37.33 
 
 
686 aa  333  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  32.97 
 
 
1056 aa  294  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  35.76 
 
 
1096 aa  281  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  32.94 
 
 
1055 aa  276  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2027  NAD-glutamate dehydrogenase  25.83 
 
 
1578 aa  107  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  26 
 
 
1601 aa  101  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.68 
 
 
1617 aa  100  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  25.11 
 
 
1617 aa  98.2  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  25.41 
 
 
1653 aa  95.5  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  25.13 
 
 
1638 aa  94.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  25.13 
 
 
1638 aa  94.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4521  NAD-glutamate dehydrogenase  25.72 
 
 
1614 aa  94.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.33 
 
 
1619 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.33 
 
 
1619 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.33 
 
 
1619 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  25.94 
 
 
1595 aa  94  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.59 
 
 
1643 aa  94  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  24.39 
 
 
1651 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.47 
 
 
1616 aa  92.4  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.38 
 
 
1612 aa  92  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  25.13 
 
 
1634 aa  91.3  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  27.07 
 
 
1591 aa  90.5  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.09 
 
 
1618 aa  90.5  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1385  NAD-glutamate dehydrogenase  24.5 
 
 
1404 aa  89.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.6028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  25.54 
 
 
1685 aa  90.1  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.51 
 
 
1613 aa  89.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  25.68 
 
 
1614 aa  89.7  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  27.3 
 
 
1591 aa  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  25.66 
 
 
1619 aa  89  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.66 
 
 
1626 aa  88.6  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4069  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 
1627 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255117  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  24.65 
 
 
1600 aa  88.6  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  24.73 
 
 
1602 aa  88.6  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  24.65 
 
 
1600 aa  88.6  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.48 
 
 
1586 aa  88.2  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  24.97 
 
 
1615 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  25.69 
 
 
1624 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.42 
 
 
1617 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  23.86 
 
 
1590 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  24.03 
 
 
1609 aa  86.3  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4604  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.98 
 
 
1553 aa  85.9  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  25.97 
 
 
1623 aa  85.5  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  24.26 
 
 
1622 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  24.28 
 
 
1590 aa  85.1  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  25.29 
 
 
1615 aa  84.7  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.74 
 
 
1613 aa  84.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  23.79 
 
 
1613 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.67 
 
 
1639 aa  83.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.25 
 
 
1584 aa  82.8  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  25.44 
 
 
1569 aa  82.8  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1819  NAD-glutamate dehydrogenase  27.61 
 
 
1641 aa  82.4  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  unclonable  0.000181151  decreased coverage  0.00683073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  23.82 
 
 
1614 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  24.95 
 
 
1627 aa  82  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  26.84 
 
 
1626 aa  82  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  28.25 
 
 
1611 aa  81.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  26.63 
 
 
1646 aa  82  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  25.98 
 
 
1656 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.74 
 
 
1623 aa  81.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  26.92 
 
 
1613 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  27.03 
 
 
1663 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 
1642 aa  80.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.12 
 
 
1582 aa  80.1  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  26.43 
 
 
1685 aa  80.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 
1622 aa  80.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  27.03 
 
 
1621 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.9 
 
 
1642 aa  78.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1099  hypothetical protein  27.37 
 
 
1382 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  23.8 
 
 
1119 aa  78.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3850  NAD-glutamate dehydrogenase  25.5 
 
 
1613 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415797  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  26.73 
 
 
1621 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  23.23 
 
 
1119 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  26.63 
 
 
1613 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  26.63 
 
 
1613 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  26.63 
 
 
1613 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  25.38 
 
 
1610 aa  77.4  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4115  glutamate dehydrogenase (NADP)  25.07 
 
 
365 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  26.43 
 
 
1621 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  23.5 
 
 
1595 aa  76.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.7 
 
 
1613 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  27.37 
 
 
985 aa  75.5  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0586845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  26.26 
 
 
1625 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  24.3 
 
 
1585 aa  75.1  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  23.56 
 
 
1550 aa  75.1  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.95 
 
 
1628 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02008  NAD-specific glutamate dehydrogenase  22.01 
 
 
1511 aa  74.7  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  25.81 
 
 
1614 aa  74.7  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  25.46 
 
 
1663 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.3 
 
 
1628 aa  74.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>