166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78004 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  54.85 
 
 
1096 aa  1087    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  45.87 
 
 
1056 aa  869    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  100 
 
 
1055 aa  2175    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  36.32 
 
 
1097 aa  306  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.9 
 
 
981 aa  298  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  28.86 
 
 
1017 aa  290  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  32.79 
 
 
1003 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  34.11 
 
 
984 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  34.29 
 
 
1008 aa  257  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  32.49 
 
 
1004 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  34.05 
 
 
986 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  31.96 
 
 
992 aa  243  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.28 
 
 
986 aa  240  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  32.57 
 
 
986 aa  237  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  32.41 
 
 
992 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  31.95 
 
 
686 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  24.51 
 
 
1591 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  25 
 
 
1586 aa  101  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  24.33 
 
 
1574 aa  100  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  24.96 
 
 
1591 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  25.09 
 
 
1619 aa  94.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  24.96 
 
 
1626 aa  93.2  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  22.88 
 
 
1119 aa  92  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  23.7 
 
 
1595 aa  92  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  25.7 
 
 
1590 aa  91.7  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  22.66 
 
 
1119 aa  90.9  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  23.88 
 
 
1550 aa  90.1  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  23.51 
 
 
985 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0586845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  23.03 
 
 
1609 aa  90.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  23.88 
 
 
1583 aa  89.4  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  24.16 
 
 
1605 aa  89.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.49 
 
 
1582 aa  89  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  23.81 
 
 
1585 aa  89  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  24.58 
 
 
1685 aa  88.6  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.7 
 
 
1616 aa  88.6  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  25.11 
 
 
1601 aa  88.2  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  24.24 
 
 
1651 aa  88.2  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  23.84 
 
 
1614 aa  87.8  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  23.31 
 
 
1600 aa  86.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  25.17 
 
 
1586 aa  86.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  23.31 
 
 
1600 aa  85.9  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  22.84 
 
 
1627 aa  84.7  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  25.89 
 
 
1615 aa  85.1  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  21.18 
 
 
1612 aa  84  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.56 
 
 
1643 aa  84  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0829  NAD-glutamate dehydrogenase  23.35 
 
 
1663 aa  84.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  24.67 
 
 
1602 aa  84  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  25 
 
 
1611 aa  82.8  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  23.99 
 
 
1685 aa  82.4  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.84 
 
 
1617 aa  82.4  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  23.7 
 
 
1610 aa  82  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.5 
 
 
1628 aa  82  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  25.17 
 
 
1617 aa  82  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  24.96 
 
 
1614 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.88 
 
 
1642 aa  81.3  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1539  hypothetical protein  23.8 
 
 
1625 aa  80.1  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  22.4 
 
 
1674 aa  80.1  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0514  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  23.47 
 
 
1586 aa  80.1  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.683628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.48 
 
 
1614 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.48 
 
 
1614 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.48 
 
 
1614 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  24.8 
 
 
1614 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  23.53 
 
 
1663 aa  80.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  24.8 
 
 
1614 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  24.18 
 
 
1590 aa  79.7  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  21.08 
 
 
1624 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  24.8 
 
 
1614 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  23.8 
 
 
1625 aa  79.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.65 
 
 
1584 aa  79  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0077  NAD-glutamate dehydrogenase  22.73 
 
 
1614 aa  78.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285162  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  22.58 
 
 
1614 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  24.47 
 
 
1122 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  22.78 
 
 
1658 aa  77.4  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.263368 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  23.27 
 
 
1614 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1385  NAD-glutamate dehydrogenase  22.49 
 
 
1404 aa  77  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.6028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  23.48 
 
 
1622 aa  77  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.23 
 
 
1639 aa  77  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  22.14 
 
 
1646 aa  77  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3757  hypothetical protein  25.07 
 
 
1618 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  23.64 
 
 
1638 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  23.64 
 
 
1638 aa  76.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  23.46 
 
 
1621 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  23.26 
 
 
1613 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  23.26 
 
 
1613 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  23.26 
 
 
1613 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  25.56 
 
 
1621 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  23.69 
 
 
1614 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  25.19 
 
 
1663 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.38 
 
 
1628 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1724  NAD-glutamate dehydrogenase  25.38 
 
 
1618 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  25.56 
 
 
1621 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  24.4 
 
 
1595 aa  74.7  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  22.98 
 
 
1634 aa  74.7  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24445  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25.1 
 
 
1620 aa  74.7  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.596581  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2593  hypothetical protein  24.95 
 
 
1614 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2072  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  24.9 
 
 
1620 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.58 
 
 
1613 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0066  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  25.38 
 
 
1569 aa  73.2  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.45 
 
 
1613 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.07 
 
 
1621 aa  72.8  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>