More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2024 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.88 
 
 
981 aa  872    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  65.08 
 
 
1017 aa  1286    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  61.12 
 
 
984 aa  1233    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  100 
 
 
1008 aa  2061    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  38.41 
 
 
1003 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  36.35 
 
 
1097 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  32.44 
 
 
1004 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  35 
 
 
986 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.51 
 
 
986 aa  406  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  35.6 
 
 
992 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  33.09 
 
 
986 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.02 
 
 
992 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  37.57 
 
 
686 aa  365  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  33.11 
 
 
1056 aa  298  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  29.04 
 
 
1096 aa  287  8e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  31.48 
 
 
1055 aa  261  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  27.2 
 
 
1685 aa  128  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  27.8 
 
 
1685 aa  118  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  28.8 
 
 
1614 aa  117  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  25.9 
 
 
1617 aa  109  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  25.58 
 
 
1613 aa  108  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  25.45 
 
 
1613 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0851  NAD-glutamate dehydrogenase  23.92 
 
 
1595 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.601054  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  25.19 
 
 
1613 aa  105  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  25.19 
 
 
1613 aa  105  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  25.19 
 
 
1613 aa  105  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  25.92 
 
 
1585 aa  104  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  24.65 
 
 
1634 aa  103  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.45 
 
 
1613 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2928  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.48 
 
 
1613 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.606686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  26.01 
 
 
1590 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.83 
 
 
1613 aa  102  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.97 
 
 
1623 aa  101  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  24.45 
 
 
1609 aa  101  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4010  NAD-glutamate dehydrogenase  25.77 
 
 
1622 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.633534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  27 
 
 
1651 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  23.97 
 
 
1614 aa  99  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  26.78 
 
 
1590 aa  99  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.91 
 
 
1618 aa  98.2  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.03 
 
 
1643 aa  97.8  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  28.88 
 
 
1613 aa  97.8  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  27.91 
 
 
1591 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  28.18 
 
 
1613 aa  97.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  28.1 
 
 
1628 aa  95.9  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  26.23 
 
 
1626 aa  95.5  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.1 
 
 
1617 aa  95.5  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  26.93 
 
 
1602 aa  95.1  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  26.3 
 
 
1630 aa  94.7  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2027  NAD-glutamate dehydrogenase  27.84 
 
 
1578 aa  94.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  28.73 
 
 
1627 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  26.44 
 
 
1600 aa  93.6  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  26.44 
 
 
1600 aa  93.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.77 
 
 
1616 aa  92.8  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  27.91 
 
 
1591 aa  92.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  23.8 
 
 
1614 aa  92.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02008  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.81 
 
 
1511 aa  92.4  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  30.4 
 
 
1639 aa  91.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  27.46 
 
 
1595 aa  91.3  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1598  NAD-glutamate dehydrogenase  28.82 
 
 
1621 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000510782 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1371  putative glutamate dehydrogenase, NAD-specific  25.32 
 
 
1619 aa  90.9  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  28.11 
 
 
1614 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2080  NAD-glutamate dehydrogenase  28.82 
 
 
1663 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.264525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2569  NAD-glutamate dehydrogenase  25.37 
 
 
1623 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.768031  normal  0.550986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18860  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  24.67 
 
 
1621 aa  90.1  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3660  NAD-glutamate dehydrogenase  28.82 
 
 
1621 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89214  normal  0.99848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.05 
 
 
1612 aa  90.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1311  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.32 
 
 
1626 aa  90.1  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.283879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  26.65 
 
 
1656 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1591  NAD-glutamate dehydrogenase  28.82 
 
 
1621 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.211689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  23.54 
 
 
1614 aa  89  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2440  NAD-glutamate dehydrogenase  22.91 
 
 
1614 aa  89  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2433  NAD-glutamate dehydrogenase  22.91 
 
 
1614 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1911  NAD-glutamate dehydrogenase  22.91 
 
 
1614 aa  88.2  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.329452  normal  0.0735968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2553  NAD-glutamate dehydrogenase  22.91 
 
 
1614 aa  88.2  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46973  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  29.67 
 
 
1625 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  27.77 
 
 
1646 aa  87  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3206  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.04 
 
 
1628 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0792493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  27.86 
 
 
1642 aa  86.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  23.8 
 
 
1605 aa  86.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  29.49 
 
 
1586 aa  86.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  27.42 
 
 
1674 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2195  NAD-glutamate dehydrogenase  23.4 
 
 
1614 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.83 
 
 
1617 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  27.88 
 
 
1638 aa  85.1  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  27.88 
 
 
1638 aa  85.1  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1385  NAD-glutamate dehydrogenase  26.48 
 
 
1404 aa  84.7  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.6028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12500  NAD-dependent glutamate dehydrogenase gdh  25.48 
 
 
1624 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427584 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  24.2 
 
 
1119 aa  84.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.66 
 
 
1619 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.66 
 
 
1619 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  25.43 
 
 
1615 aa  83.2  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  25.3 
 
 
1622 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2221  NAD-glutamate dehydrogenase  24.22 
 
 
1615 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.988554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  26.73 
 
 
1619 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4521  NAD-glutamate dehydrogenase  27.27 
 
 
1614 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1456  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.8 
 
 
1623 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  27.48 
 
 
1601 aa  82.4  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.76 
 
 
1582 aa  82.4  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1729  NAD-glutamate dehydrogenase  24.56 
 
 
1614 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.752512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  29.97 
 
 
1653 aa  82  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>