169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1444 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1564  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  76.17 
 
 		 686 aa  1092    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0612615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1728  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  72.5 
 
 		 992 aa  1490    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.398358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1444  Glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 986 aa  2030    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0691  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  62.18 
 
 		 992 aa  1251    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000693443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0111  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  65.16 
 
 		 1004 aa  1320    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0956  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  74.01 
 
 		 986 aa  1514    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2777  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  95.74 
 
 		 986 aa  1959    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1382  glutamate dehydrogenase (NAD)  34.28 
 
 		 984 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.257754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  34.65 
 
 		 1017 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.907313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2024  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  34.36 
 
 		 1008 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203605  normal  0.826831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0171  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.89 
 
 		 981 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.875485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4376  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  33.54 
 
 		 1003 aa  337  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5366  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45239  predicted protein  32.91 
 
 		 1097 aa  283  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536296  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00180  glutamate dehydrogenase, putative  31.53 
 
 		 1056 aa  244  7e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.481448  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78004  NAD-specific glutamate dehydrogenase  33.72 
 
 		 1055 aa  238  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07451  NAD dependent glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6XNK7]  31.51 
 
 		 1096 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3605  NAD-glutamate dehydrogenase  27.75 
 
 		 1685 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2684  NAD-glutamate dehydrogenase  25.36 
 
 		 1614 aa  114  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.631766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3663  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.24 
 
 		 1625 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2481  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.08 
 
 		 1617 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3986  NAD-glutamate dehydrogenase  26.85 
 
 		 1685 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244751 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1340  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.93 
 
 		 1612 aa  110  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1660  NAD-glutamate dehydrogenase  25.62 
 
 		 1609 aa  108  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4787  NAD-glutamate dehydrogenase  26.9 
 
 		 1615 aa  108  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1684  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1122 aa  107  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2529  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.86 
 
 		 1618 aa  106  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1110  NAD-glutamate dehydrogenase  25.21 
 
 		 1605 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0299  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1119 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2930  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.03 
 
 		 1642 aa  103  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2430  NAD-glutamate dehydrogenase  25.07 
 
 		 1617 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2694  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  26.44 
 
 		 1550 aa  102  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4011  NAD-glutamate dehydrogenase  26.88 
 
 		 1614 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0315  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1119 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4521  NAD-glutamate dehydrogenase  26.2 
 
 		 1614 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4368  NAD-glutamate dehydrogenase  26.48 
 
 		 1601 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3670  NAD-glutamate dehydrogenase  25.16 
 
 		 1615 aa  100  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2699  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.86 
 
 		 1617 aa  100  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0650155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1031  NAD-glutamate dehydrogenase  25.99 
 
 		 1610 aa  99.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4838  NAD-glutamate dehydrogenase  26.22 
 
 		 1638 aa  99  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3761  NAD-glutamate dehydrogenase  26.22 
 
 		 1638 aa  99  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11780  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.92 
 
 		 1643 aa  98.2  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.313552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1129  NAD-glutamate dehydrogenase  23.88 
 
 		 1651 aa  98.2  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3020  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.21 
 
 		 1628 aa  97.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3422  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.05 
 
 		 1586 aa  97.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3725  NAD-glutamate dehydrogenase  25.24 
 
 		 1622 aa  97.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1509  NAD-glutamate dehydrogenase  25.19 
 
 		 1590 aa  96.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1432  NAD-glutamate dehydrogenase  24.56 
 
 		 1611 aa  96.3  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0919743  normal  0.751612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1288  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.91 
 
 		 1613 aa  95.9  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.889016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1427  NAD-glutamate dehydrogenase  25.3 
 
 		 1586 aa  95.5  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4237  NAD-glutamate dehydrogenase  24.5 
 
 		 1591 aa  95.1  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2078  NAD-glutamate dehydrogenase  25.37 
 
 		 1585 aa  94.7  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.660991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2779  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.04 
 
 		 1616 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1749  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.78 
 
 		 1584 aa  93.6  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1225  glutamate dehydrogenase (NAD)  27.45 
 
 		 1639 aa  93.6  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00479  NAD-glutamate dehydrogenase  24.56 
 
 		 1674 aa  93.2  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0771  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  24.87 
 
 		 1583 aa  92.8  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0829  NAD-glutamate dehydrogenase  24.14 
 
 		 1663 aa  92  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2605  NAD-glutamate dehydrogenase  23.89 
 
 		 1614 aa  92.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7895  NAD-glutamate dehydrogenase  25.19 
 
 		 1656 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0934  NAD-glutamate dehydrogenase  24.14 
 
 		 1663 aa  92.4  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1449  NAD-glutamate dehydrogenase  25.74 
 
 		 1625 aa  91.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569456  normal  0.5643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3614  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.21 
 
 		 1619 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3687  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.21 
 
 		 1619 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0842  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.95 
 
 		 1613 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72085  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3619  glutamate dehydrogenase (NAD)  25.21 
 
 		 1619 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.932598  normal  0.474006 
 
 
-
 
NC_002978  WD0223  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1574 aa  90.1  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18860  NAD-dependent glutamate dehydrogenase  25.08 
 
 		 1621 aa  90.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1927  NAD-glutamate dehydrogenase  25.46 
 
 		 1627 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4626  NAD-glutamate dehydrogenase  24.54 
 
 		 1634 aa  90.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841907  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2978  NAD-glutamate dehydrogenase  23.4 
 
 		 1594 aa  90.1  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.981083  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5617  NAD-glutamate dehydrogenase  24.26 
 
 		 1613 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1137  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.45 
 
 		 1613 aa  90.1  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204013  normal  0.359646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3684  NAD-glutamate dehydrogenase  24.26 
 
 		 1613 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4683  NAD-glutamate dehydrogenase  24.26 
 
 		 1613 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0789  NAD-glutamate dehydrogenase  24.49 
 
 		 1646 aa  90.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4991  NAD-glutamate dehydrogenase  25.74 
 
 		 1642 aa  89.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2140  NAD-glutamate dehydrogenase  24 
 
 		 1614 aa  89  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.520621  normal  0.34702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4077  NAD-glutamate dehydrogenase  24.08 
 
 		 1613 aa  89  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.993105  normal  0.739224 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0306  glutamate dehydrogenase (NAD)  22.99 
 
 		 1582 aa  89  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1181  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.77 
 
 		 1623 aa  88.6  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3187  NAD-glutamate dehydrogenase  24.68 
 
 		 1595 aa  88.6  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558998  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4527  NAD-glutamate dehydrogenase  25.45 
 
 		 1613 aa  88.2  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1785  glutamate dehydrogenase (NAD)  24.01 
 
 		 1614 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3797  NAD-glutamate dehydrogenase  24.3 
 
 		 1653 aa  87.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.847994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2258  NAD-glutamate dehydrogenase  25.76 
 
 		 1572 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1680  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.85 
 
 		 1614 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.959155  normal  0.0768547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1755  glutamate dehydrogenase (NAD)  23.85 
 
 		 1614 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1809  NAD-glutamate dehydrogenase  24.63 
 
 		 1614 aa  87  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.785222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1575  NAD-glutamate dehydrogenase  26.63 
 
 		 1590 aa  86.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2802  NAD-glutamate dehydrogenase family protein  25.73 
 
 		 1621 aa  85.9  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2002  NAD-glutamate dehydrogenase  23.49 
 
 		 1612 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2476  NAD-glutamate dehydrogenase  24.14 
 
 		 1614 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450478  hitchhiker  0.00166764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1944  NAD-glutamate dehydrogenase  21.45 
 
 		 1626 aa  85.1  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4541  NAD-glutamate dehydrogenase  23.9 
 
 		 1613 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.307846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08770  NAD-specific glutamate dehydrogenase  25.73 
 
 		 1630 aa  85.1  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0347841  normal  0.226839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1084  NAD-glutamate dehydrogenase  23.48 
 
 		 1602 aa  85.1  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1444  hypothetical protein  25 
 
 		 1625 aa  84.7  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3913  NAD-glutamate dehydrogenase  23.25 
 
 		 1591 aa  84.7  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0782582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1751  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1600 aa  84.7  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.64982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1819  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1600 aa  84.7  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>